新研究揭示现代大豆品种重要性状结构变异。 近日,《自然—遗传学》(Nature Genetics)在线发表河北农业大学张彩英团队研究论文。该研究率先组装高产优质抗病现代品种农大豆2号高质量基因组,在基因组水平发掘现代大豆育成品种特有结构变异及其作用,并揭示影响黄淮海地区大豆群体重要产量和品质性状的结构变异与基因,为大豆遗传改良提供新的理论依据和基因组资源。
农大豆2号。河北农大供图
大豆种植实验田。河北农大供图
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该研究还挖掘出上万个基于现代大豆品种基因组结构变异,发现一批影响基因表达的新变异。为有效利用现代大豆育成品种基因组变异,研究者将农大豆2号与29个已公布大豆品种基因组构建图形化泛基因组,鉴定到47058个结构变异,包括37304个插入/缺失、3071个倒位和6683个易位,筛选到25814个可能影响基因表达的新变异;挖掘出13个现代大豆育成品种农大豆2号特有结构变异,其中7个影响株高、单株荚数、百粒重等产量性状以及籽粒蛋白质、油分、异黄酮等品质性状。
河北农业大学研究员张彩英,博士邵振启、孔佑宾,副教授杜汇、李文龙、杨占武,以及北京诺禾致源生物科技公司李祥孔为该论文的共同第一作者。张彩英、河北农业大学教授李喜焕、马峙英以及北京诺禾致源生物科技公司研究员田仕林为该论文的通讯作者。该研究得到河北省现代农业科技奖励后补助资金项目以及河北省科技计划项目资助。(来源:中国科学报 李晨)
相关论文信息:https://doi.org/10.1038/s41588-024-01901-9
作者:张彩英等 来源:《自然—遗传学》