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血浆和红细胞microRNA表达谱及其与蚕豆病的相关性研究

血浆和红细胞microRNA表达谱及其与蚕豆病的相关性研究
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  • 批准号:81641010
  • 批准年度: 2016年
  • 学科分类:遗传性血液病(H0815) |
  • 项目负责人:杜冠魁
  • 负责人职称:副教授
  • 依托单位:海南医学院
  • 资助金额:10万元
  • 项目类别:应急管理项目
  • 研究期限:2017年01月01日 至 2017年12月31日
  • 中文关键词: 血浆;红细胞;microRNA;蚕豆病;相关性研究
  • 英文关键词:favism;G6PD deficiency;plasma ;erythrocyte ;microRNA

项目摘要

中文摘要

G6PD缺乏症是蚕豆病发生的遗传基础,G6PD缺乏症患者对蚕豆反应具有个体差异性。研究表明microRNA在血液系统疾病的发生过程中具有重要作用。本课题通过收集蚕豆病发病病人血样,采用新一代测序的方法分析血浆中microRNA表达谱,寻找与蚕豆病相关的特征性microRNA,并在群体中验证。用生物信息学方法分析预测这些microRNA影响的靶基因和调控其表达的转录因子,通过功能聚类和富集寻找与蚕豆病发病相关的功能基因,并通过免疫印迹试验验证红细胞中被调控蛋白的表达情况,为阐明蚕豆病发生的分子机制提供科学依据。

英文摘要

G6PD deficiency is the genetic basis of favism. However, the response to fava bean is heterozygous among G6PD deficiency patients. Several researches showed that microRNAs play important role in the development of blood diseases. To search the characteristic microRNA in erythrocytes and plasma associated with favism, we use next-generation sequencing approaches to analyze microRNAs expression profiles in the matured red blood cells and plasma from favism patients, G6PD deficient patients and normal controls. The characteristic microRNAs are verified by QRT-PCR in large sample. Bioinformatic methods are used to predict the targets of the characteristic microRNAs and the transcription factors that regulate the expression of the characteristic microRNAs. The GO and KEGG Pathway enrichment analysis are carried to search differentially expressed microRNA and functional genes correlated with pathogenesis of favism. The expression of the target erythrocyte proteins will be verified by western blot. The study will demonstrate the roles of microRNAs in the development of favism at molecularlevels and provide scientific evidence for elucidating the molecular mechanism of favism.

结题摘要

G6PD缺乏症是蚕豆病发生的遗传基础,G6PD缺乏症患者对蚕豆反应具有个体差异性。研究表明microRNA在血液系统疾病的发生过程中具有重要作用。本课题通过收集蚕豆病发病病人血样,采用新一代测序的方法分析红细胞和血浆中microRNA表达谱,寻找与蚕豆病相关的特征性microRNA。通过microRNA测序,蚕豆病患者红细胞中找到10个microRNA (rno-miR-183-5p, rno-miR-1912-3p, rno-miR-199a-3p, rno-miR-214-3p, rno-miR-3473, rno-miR-34c-5p, rno-miR-3552, rno-miR-483-3p, rno-miR-764-5p, rno-miR-96-5p),与G6PD缺乏症患者具有显著差异。这些microRNA涉及多个与细胞组成相关的GO进程,如cell part, organelle, membrane part, macromolecular complex等。蚕豆病患者的microRNA分析表明,这些在红细胞中残存的microRNA可能影响红细胞的膜结构及细胞生长进程。

评估说明

    国家自然科学基金项目“血浆和红细胞microRNA表达谱及其与蚕豆病的相关性研究”发布于爱科学iikx,并永久归类于相关科学基金导航中,仅供广大科研工作者查询、学习、选题参考。国科金是根据国家发展科学技术的方针、政策和规划,以及科学技术发展方向,面向全国资助基础研究和应用研究,发挥着促进我国基础研究源头创新的作用。国科金的真正价值在于它能否为科学进步和社会发展带来积极的影响。

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