近期研究表明，miRNA靶基因3′UTR内存在的单核苷酸多态性（SNPs）影响了miRNA对靶基因表达的抑制作用，并提示这一机制可能与肿瘤易感性相关。本项目首先拟采用生物信息学方法筛选出肝细胞肝癌（HCC）相关的候选基因，在这些候选基因的3′UTR内预测目前人类已知miRNA的结合靶点，然后在预测靶点内筛出候选SNPs。在HCC患者与正常对照人群中对上述候选SNPs进行基因分型，筛选出两组中等位基因频率存在显著性差异的SNPs，并验证其与HCC的关联性。最后通过分子生物学方法及功能检测深入研究这些SNPs在HCC发生发展过程中的分子信号通路以及相关miRNA的作用机制，为最终阐明遗传变异影响HCC易感性的分子机理和设计研发特异性的HCC诊断治疗途径奠定基础。

本研究首先采用生物信息学方法筛选了HCC相关基因miRNA结合靶点内的多态，进行了系列病例对照研究及阳性多态的功能分析。从中我们找到了数个与HCC易感性相关的遗传标记。主要发现如下：第一、首次证实位于白介素1α（IL1A） 基因3'UTR中一个4 碱基插入缺失多态（rs3783553）破坏了microRNA-122 和microRNA-378 与靶基因序列的结合，进而使得白介素1α表达增加进而参与HCC的发生。本研究的结果提示白介素1α有望成为HCC 免疫治疗、早期诊断及治疗的潜在靶点；第二、βTrCP 基因3'UTR中一个9碱基插入缺失多态（rs16405）与HCC 发生有关。利用Real-timeRT-PCR 方法我们发现该多态的基因型与βTrCP mRNA 显著相关。生物信息学预测显示，该多态可能通过影响microRNA-920与其靶序列的结合实现对靶基因表达的调节；第三、我们的研究还发现HLA-G 基因、COL1A2基因和MDM2基因中的插入缺失多态均与HCC易感性显著相关。本研究筛选出了数个与HCC易感性显著相关的多态，为阐明遗传变异影响HCC易感性的分子机理奠定了基础。