狼疮肾炎是由于肾脏IgG为主的免疫复合物沉积继发免疫性炎症造成。动物模型表明基因敲除Fcγ受体γ链则可阻止狼疮肾炎的发生，提示Fcγ受体相关基因在其中发挥重要作用。基因拷贝数是新近人类基因组上发现的多态性，基因拷贝数可能具有量效性（dosage effect）,并且可能是多基因病发病的重要遗传机制。Fcγ受体相关基因FCGR2A、2B、2C和FCGR3A、3B存在着基因拷贝变异，我们前期研究发现FCGR3B基因拷贝数和狼疮肾炎发病及病理损伤程度密切相关。进一步我们将利用本研究所狼疮肾炎临床-病理-基因数据库收集500多名狼疮肾炎和前期采用实时定量PCR建立的基因拷贝数测定方法，建立多基因交互作用数学模型，探讨抑制性和兴奋性Fcγ受体基因拷贝数在狼疮肾炎发病及病理表型异质性中的作用，并进一步探讨其对Fcγ受体基因表达及免疫细胞ADCC效应的影响，进行功能验证。

本课题通过对2589例狼疮和正常对照探讨狼疮发病遗传分子机制（1） FCGR2A及相关基因TLR9下游基因IRF5与中国狼疮发病，并和疾病进展有关（TLR9）；而在白人中发现的FCGR3B基因拷贝数和中国人LN发病无关（2）基于GWAS研究提供的信息，提出狼疮发生发展的两个致病通路（pathway） T/B淋巴细胞异常-NFκB信号通路和自噬通路的候选基因通过交互作用参与狼疮发病假说。并通过大样相关分析发现在单基因水平T/B-NFκB通路的BLK，TNFSF4，和TNFAIP3 的SNPs与SLE发病相关；进一步的基因-基因交互作用分析提示BLK与TNFAIP3，TNFSF4与TNFAIP3，BLK与TNFSF4之间存在相乘效应的交互作用。自噬关联的基因座位PRDM1-ATG5基因间区遗传变异在受试人群中（两个中国人对列和一个高加索人队列）中与SLE发病易感性一致性相关联；生物信息学和体外淋巴细胞分选的基因表达实验分析均提示PRDM1-ATG5基因间区遗传变异影响ATG5及其下游基因表达；进一步基于通路遗传学关联分析显示ATG7和IRGM也是SLE易感基因。上述成果发表SCI论文12篇