目前印记基因及其印记机制是表观遗传学研究的重点和热点之一。印记基因具有影响哺乳动物早期胚胎发育的功能，印记机制是解释这种功能的有效途径之一。然而对猪早期胚胎发育相关印记基因及其印记机制的研究相当有限。在前期研究的基础上，本项目拟率先尝试建立猪孤雄生殖胚胎体外培养（IVC）的实验系统，以猪的孤雄生殖和/或孤雌生殖及两性正常生殖的桑椹胚和囊胚为研究材料，应用高通量的芯片技术筛选差异表达的候选印记基因；利用三种技术组合分离与鉴定猪早期胚胎发育相关印记基因；利用xChIP技术分离印记基因互作因子并检测蛋白质修饰；在试验猪群中研究印记基因与胚胎发育性状的关联。旨在分离与鉴定具有我国自主知识产权的猪早期胚胎发育相关印记基因并初步揭示其印记机制。研究结果为猪早期胚胎发育的表观遗传学理论和实践提供新资料，为开展猪相关性状的标记辅助选择提供有用的基因标记，为改善传统的猪育种方式注入新思路。

印记基因具有影响哺乳动物早期胚胎发育的功能，然而目前对猪早期胚胎发育相关印记基因及其印记机制的研究相当有限。在前期研究的基础上，本项目收集了异常克隆猪，正常克隆猪，正常In Vivo猪的肌肉组织样。为了排除个体及系统误差，克隆猪为全同胞个体，并分别使用3个个体形成pool；2）利用Illumina HiSeq? 2000对3个pool提取的RNA 进行测序；3）对测序数据进行后期分析，发现一些与异常克隆相关的基因。4）对Kcnq1ot1印记基因座的两个基因Lit1和Cdkn1c以及NAP1L5基因进行了克隆、测序、SNPs、印记表达和启动子甲基化进行了检测；5）发表SCI论文1篇，中英文核心期刊论文2篇，中国科技论文在线论文2篇。本项目分离与鉴定了具有我国自主知识产权的猪早期胚胎发育相关印记基因并初步揭示了其印记机制，研究结果为猪早期胚胎发育的表观遗传学理论和实践提供新资料。