2005-2007年，对我国杂草稻的分布和危害进行了12批次调查，选择环境条件和种植制度一致、面积1亩的田块为单位样方，10个单位样方构成一个样点，共85个市的1340个样点，基本覆盖了我国水稻主要种植区系，采集杂草稻样本1276份，表明杂草稻在我国部分种植区系的部分区域的发生面积和危害程度已比较大，部分种植区系还仅为少量发生或尚未发生，但蔓延危害趋势显著。本研究拟通过调查1276份杂草稻的生物学性状，和细胞核和细胞器分子标记，以及驯化基因克隆、叶绿体单倍型分析，进行中国杂草稻的生态型分类，和研究各地杂草稻的传播路径，有利于近期预防和控制杂草稻的蔓延。此外，由于杂草稻遗传基础研究薄弱，杂草稻与水稻的内在差异区分不清，导致目前世界上还没有一种方法可以有效地控制杂草稻，本项目拟筛选最具杂草典型性状的杂草稻，构建国际上第一张以杂草稻防除为目的的杂草稻遗传连锁图谱，有利于杂草稻的长期防治。

通过本项目的研究，明确了我国杂草稻的具体定义，召开了杂草稻论坛及培训班，普及杂草稻知识；调查了3576个样点，采集样品7930份，制作了相应的杂草稻标本，绘制了我国杂草稻的综合草害值和频度的GIS图，基本明确了杂草稻在我国的发生和危害，这些将有助于从全局角度制订我国杂草稻的防治工作策略；对已产生严重危害江苏和辽宁杂草稻的生物学性状研究，初步揭示了两省杂草稻性状变异丰富，将有助于我国杂草稻的宣传识别防治工作的开展；杂草稻群体遗传研究初步揭示了辽宁、江苏和广东杂草稻之间的相互关系，将有利于我国杂草稻的分稻区分省市的防治工作的实施；进行了微卫星连锁图谱绘制，为了解我国杂草稻的杂草特性及长期防治打下基础。本项目三年期间总计发表SCI论文2篇，核心期刊7篇，培养毕业博士2名，硕士3名，举办全国杂草稻学术会议1次。对照申请书的预期研究结果（SCI 2篇，中文期刊 4篇），达到了项目要求，没有辜负基金委对我们的信任。这些为下一步我国杂草稻的溯源研究和杂草稻的防治工作打下了坚实基础。