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山核桃成花相关长链非编码RNA挖掘与功能分析

山核桃成花相关长链非编码RNA挖掘与功能分析
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  • 批准号:31570666
  • 批准年度: 2015年
  • 学科分类:林木遗传改良(C161002) |
  • 项目负责人:王正加
  • 负责人职称:教授
  • 依托单位:浙江农林大学
  • 资助金额:63万元
  • 项目类别:面上项目
  • 研究期限:2016年01月01日 至 2019年12月31日
  • 中文关键词: 核桃;长链;非编码;RNA;挖掘
  • 英文关键词:hickory;lncRNA;floweral development;Functional Analysis

项目摘要

中文摘要

山核桃雌雄同株、童期长,雌雄花发育过程中的营养生长向生殖生长转变是花发育一个非常重要的关键点。lncRNA在调控植物发育方面发挥着重要作用。本项目基于山核桃全基因组序列、成花相关表达谱、microRNA和成花相关基因功能等方面的研究,构建山核桃雌雄花发育过程中营养生长和生殖生长阶段的4个lncRNA文库,运用高通量测序及生物信息学方法分析挖掘得到山核桃成花期的保守和新的lncRNA及其靶基因,并应用统计学方法分析雌雄花营养生长和生殖生长过程中的lncRNA表达差异,将表达差异显著的lncRNA及其靶基因转入山核桃胚胎干细胞和拟南芥中验证功能,并利用酵母单杂和ChIRP技术分析关键lncRNA与DNA和蛋白相互作用,从而解析lncRNA在山核桃成花过程的分子调控功能。

英文摘要

Hickory hermaphrodite, longer of Juvenile phase, male and female flowers during the development of vegetative growth to reproductive growth transformation of flower. Development is a very important key points. lncRNA plays an important role in the regulation of plant development aspects. The project is based on the complete genome sequence of pecan, flower-related expression profiling, microRNA and flower studies of gene function and other aspects related to construct during the development of male and female flowers pecan vegetative and reproductive growth stages 4 lncRNA library, using Qualcomm the amount of sequencing and bioinformatics analysis of mining to get conservative and new lncRNA its target gene pecans into flowering, and apply statistical methods to analyze male and female flowers vegetative and reproductive growth during lncRNA expression differences, significant differences in the expression lncRNA its target gene into embryonic stem cells and pecan validation Arabidopsis and yeast one-hybrid and ChIRP lncRNA key technical analysis with DNA and proteins interact to resolve the molecular regulation function lncRNA flowering process in Hickory .

评估说明

    国家自然科学基金项目“山核桃成花相关长链非编码RNA挖掘与功能分析”发布于爱科学iikx,并永久归类于相关科学基金导航中,仅供广大科研工作者查询、学习、选题参考。国科金是根据国家发展科学技术的方针、政策和规划,以及科学技术发展方向,面向全国资助基础研究和应用研究,发挥着促进我国基础研究源头创新的作用。国科金的真正价值在于它能否为科学进步和社会发展带来积极的影响。

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