申请人主要研究领域为功能性食品微生物学。在功能性益生乳酸菌定向筛选与功能评价、益生菌生理生化与遗传特性解析、益生菌与环境互作与应用技术基础研究方面，已取得系列有重要影响的创新性成绩：优化建立了调节胆固醇和血脂、辅助降血压、拮抗重要食源性致病菌等7种功能性益生菌的筛选模型；筛选了植物乳杆菌ST-III等15株优良益生菌菌株并进行了功能评价；完成了4株专利益生菌的全基因组测序和分析，解析了植物乳杆菌ST-III等生理特性及遗传性状的分子基础；开展了益生菌高密度培养、高活性制备的相关基础性研究；近五年发表SCI论文36篇，最高影响因子3.943（JB，4篇），单篇最高他引11次；获国家科技进步二等奖1项（排名第1），部省级科学技术一等奖2项（第1和第3），国家发明专利授权6项。同时申请人入选了“新世纪百千万人才工程”国家级人选和教育部新世纪优秀人才支持计划。

功能性益生菌的研究开发、机制探索及与宿主的互作是益生菌研究领域的前言问题和热点核心。针对这些核心问题，本项目围绕以下几个方面开展研究，并取得相应的进展：1、益生菌调节人体健康的生理机制研究肠道菌群的平衡与人体的健康状态密切相关。肠道微生物不仅通过吸收宿主不能消化的物质来供给宿主营养，而且参与多种药物和其它物质的代谢。本项目在这方面的工作培养博士生2名，硕士生2名。发表论文10篇，其中SCI 收录8篇，CSCD中文核心 2篇。申请国家发明专利4项。2、益生菌生理代谢及环境胁迫机制研究乳酸菌在工业中常常会遇到盐、酸、胆盐等环境因素的胁迫，其能在高渗环境中存活并进行生长代谢的能力对于工业生产至关重要。然而，乳酸菌生理代谢及环境胁迫的分子机制尚不清楚。针对这个问题本项目进行了深入的研究，培养博士生2名，发表SCI文章3篇，EI文章1篇。申请国家发明专利4项，获授权国家发明专利2项。3、新型功能性益生菌筛选及评价新型功能性益生菌的筛选及评价对于扩充益生菌的认识，充分发挥益生菌的益生作用有着重要的意义。针对具有缓解重金属中毒、拮抗致病菌、降低血糖等功能的研究，培养博士生3名，硕士生4名，发表论文15篇，其中SCI收录9篇，CSCD中文核心4篇，EI收录2篇。发表于AEM的关于镉吸附的文章被评为当期亮点文章。申请国家发明专利7项，获授权国家发明专利5项；申请国际发明专利4项，其中1项已获授权。授权专利“一种具有排镉功能的植物乳杆菌及其用途”获第十七届中国专利金奖。4、产脂微生物产功能性多不饱和脂肪酸的差异合成机制和调控的研究基于前期的基础，本项目在高山被孢霉产功能性多不饱和脂肪酸（PUFAs）的合成和调控方面也开展了相应的工作。高山被孢霉是目前产PUFAs真菌中唯一具有正式安全性评估的菌种，其PUFAs含量极为丰富，总脂含量达到菌体生物量干重的50%，已应用于工业生产ω6脂肪酸花生四烯酸。此外，高山被孢霉还具有积累少量ω3脂肪酸二十碳五烯酸(EPA)的能力。本项目以高山被孢酶为模型，从分子水平上解析其中脂质代谢流网络，并通过认识高山被孢酶脂质高效合成的调控机制，将其改造为高产EPA的ω6 / ω3 PUFAs均衡的脂质细胞工厂。此部分工作培养博士生1名，硕士生2名，发表SCI文章4篇，申请国家发明专利7项，获授权3项；申请国际专利4项，2项获授权。