中文摘要
核心种质是整个资源的浓缩和精华,它的建立,既保证了遗传多样性,又减少了资源数量,尤其在葡萄基因组全序列测定的情况下,更便于集中精力研究发掘优异基因为生产服务,本项目计划通过对取样比例、取样方法和组内聚类方法等的研究提出最佳的葡萄核心种质构建策略;根据《葡萄种质资源描述规范和数据标准》,在田间调查的基础上,结合《中国葡萄志》,对搜集到的基本数据和特征数据通过主成分分析筛选出若干个形态和农艺性状用于构建中国葡萄种质资源的初级核心种质及其形态和表型资料数据库;然后基于SSR和SRAP分子标记对初选核心样品进一步压缩,从而构建出葡萄核心种质,并对其遗传多样性和总体种质的代表性进行检测。本研究的开展将加强和实现葡萄种质资源的有效管理及开发利用,提高中国葡萄种质资源收集、保护、评价和创新利用的效益。
结题摘要
为促进葡萄种质资源的评价和利用,进行了葡萄核心种质构建的研究。根据《葡萄种质资源描述规范和数据标准》,经连续2年田间调查,建立了葡萄表型数据库;对47项表型性状进行主成分分析抽取影响较大的性状,采用按种质类型分组和逐步聚类的方法进行初级核心种质的筛选,结果表明组内采用平方根策略,以15%抽样比例获得的124份初级核心种质,其表型保留比例和遗传多样性代表性均达到96%;为使最终的核心种质具有最大的遗传距离和最大的遗传多样性,对初级核心种质基于SSR和SRAP分子标记分别采用M策略(Core Finder和Power Core)、遗传距离法(LDSS和GDOPT)和Core Hunter法构建的种质进行了合并,经对遗传多样性相关指数和相关表型指标的统计检验,结合主坐标分析,48份葡萄核心种质以最少的种质数量保留了初级核心种质96.21%的等位基因,以5.53%的取样比例代表了原始种质92.90%的遗传多样性,表明本研究建立的核心种质是有效的。本研究结果为葡萄种质资源的科学保存、评价与鉴定,进一步发掘和利用等提供了科学依据。同时本研究所采用的方法对其它作物核心种质的构建具有重要参考价值。
