果树育种之所以落后于其它作物，最主要的一点是存在着童期长的问题。长期以来，果树育种工作者都试图找到一条途径解决这一问题，揭示花芽分化机理是缩短苹果童期的有效途径，但目前还没有太大的进展。因为基因表达的中间产物mRNA水平的研究并不能取代蛋白质水平(基因最终表达产物)的研究，mRNA与表达蛋白质的相关性不高（低于0.5），因此，要精确地研究成花基因的功能，还是要回到执行生命功能的蛋白质本身上来。本研究是在得到苹果花芽孕育期花芽、叶芽芽肉有蛋白质差异图谱的基础上，结合不同发育阶段实生苗的蛋白质差异图谱，进一步研究和确定与花芽发生相关的特异蛋白，测定其N端序列，以成花mRNA反转录的cDNA为模板，对特异蛋白基因cDNA进行测序及序列相似性检索，推导其全长氨基酸顺序。该项目的完成将对揭示苹果花芽分化的分子本质，阐明苹果花芽分化过程中从基因到性状表达的规律，加速苹果育种进程有着十分重要的意义。

苹果是世界上最重要的果树之一，但由于其童期长所以苹果育种一直落后于其它作物。因为mRNA与表达蛋白质的相关性不高（低于0.5），所以直接研究成花蛋白，克隆成花基因的启动子，解除成花阻遏蛋白，对缩短其童龄期、加速育种进程有着十分重要的意义。本研究利用现代差异蛋白质组学技术，对红富士、金冠和"红富士×金冠" 苹果短枝停长后3－9周的花芽、叶芽进行研究。结果表明, 不同品种、不同发育阶段实生树花芽孕育特异蛋白的表达规律是相同的，即分化前后有283个蛋白点在表达上有明显的质和量的变化,16.4、30.2、40.3、65.1kD为花序原始体、39.3、60.2、66.2kD为侧花、77.1kD为萼片分化表达的特异蛋白，所不同的是，实生树分化开始时多出现52.3、70.0kD特异蛋白，促花（喷PP333）或抑花（喷GA3）时特异蛋白表达是随促进或延缓分化进程变化而变化，在分化时促花出现43.3、51.1kD、抑花出现37.4kD特异蛋白。肽质量指纹谱分析,初步认为16.4kD、30.2kD是未知蛋白，40.3kD是与合成酶有关的蛋白，65.1kD是一个与转录有关的RNA结合蛋白。