物种的内涵与范围一直备受争议，地理分布过渡区研究则为了解物种范围与近缘种间关系提供了天然实验场所。巴山松与近缘种油松在形态特征、地理分布、遗传变异、代表的气候类型等方面均有所差异，但二者的地理分界与分类学关系仍处于争论之中。本项目通过巴山松与油松地理分布过渡区的形态学和遗传学研究，分析该区域松树的遗传变异模式与趋势，确定二者详细的形态学与遗传学地理分界。本研究对于认清亲缘物种的形态与遗传界线，揭示物种的本质内涵和物种稳定性维持过程中基因交流状况等机制，以及探讨巴山松和油松所代表的亚热带-暖温带这一重要生物地理分界线的生物学意义都具有重要的理论参考价值。

巴山松作为秦巴山区特有种与油松有较为密切的关系，二者的地理分界研究有助于确立巴山松的分类学地位。形态学、叶绿体、线粒体和核基因分析所揭示的巴山松与油松的地理分界线并不一致。巴山松与油松表型差异不显著，叶绿体微卫星研究揭示巴山松与油松的分界线在米仓山与狭义巴山之间，而线粒体基因分析显示二者的界线在秦岭-大巴山之间,核基因微卫星研究则表明巴山松主要分布在大巴山地区。进一步分析揭示出巴山松可能是以油松为父本以马尾松为母本的同倍体杂交种。现有居群间高度的遗传分化受到环境、分布格局、繁育系统、进化历史等多种因素的共同影响。