B细胞表位是抗原中能被抗体特异性识别的线性片段或空间构象性结构，是体液免疫的基础。确定B细胞表位对疾病预防、诊断、治疗意义重大。本项目的基本思路是将蛋白质抗原看作复杂网络，节点是氨基酸残基，边是氨基酸残基之间在序列或空间结构上的相邻关系。因此，B细胞表位可以看作是抗原这个"大图"里的一些特定子图；线性和非线性B细胞表位的预测问题被统一为从大图中搜寻特定子图的过程。本项目将在我们已有的前期工作基础上

B细胞表位是抗原中能被抗体特异性识别的线性片段或空间构象性结构，是体液免疫的基础。确定B细胞表位对疾病预防、诊断、治疗意义重大。本项目的研究目标是建立一套基于复杂网络的B细胞表位预测体系。经过几年的努力，项目取得的主要成果有：（1）构建了空间构象表位数据库，推演出4种基于复杂网络的新量表，编写了基于新量表的BEPI程序并在B细胞表位预测中显示了很好的效果；（2）构建了模拟表位数据库，编写了噬菌体展示实验数据前处理程序及基于噬菌体展示的B细胞表位预测程序，在B细胞表位的预测中显示了较好的性能。基于这些工作，我们在BMC Immunology、BMC Bioinformatics、Journal of Biomedicine and Biotechnology等国际期刊发表SCI收录论文3篇，参加国际会议5次，2篇会议论文被EI收录，2篇论文被ISTP收录，培养硕士研究生2人。