无蹼壁虎Gekko swinhonis是中国的特有种，记录于辽宁、河北、山西、陕西、甘肃、河南、山东、江苏、安徽，在浙江舟山岛有一个隔离小种群。其系统地理学有待研究，它与壁虎属其它种之间的亲缘关系尚未解决。本项目以cyt b基因，以及ND2和16S rRNA基因片段为分子标记，应用Arlequin软件包等进行核苷酸多样性、单元型多样性、遗传距离、巢式进化支等分析，定义单元型（haplotype）,

基于cyt b基因全长序列，定义了无蹼壁虎的单元型并构建了系统发生树。高达13.96%的序列分歧表明无蹼壁虎种群包括明显的A、B两大支系。两支系的分歧产生于3.19-6.38 Mya。由于秦岭-太行地理屏障形成的阻隔，它们在各自的分布区独立进化。从无蹼壁虎AC/GC富集文库中筛选出21个微卫星多态座位。完成了无蹼壁虎微卫星引物对壁虎属其它6个物种和蜥虎属2个物种的通用性检测，除1个位点外，均能至少在一个物种中扩增出稳定的条带。描记了在甘肃采到的壁虎属标本中发现的1个新种，文县壁虎Gekko wenxianensis sp. nov.。测定了大壁虎Gekko gecko的线粒体基因组全序列并合并其他蜥蜴类已发表的序列。ML、MP和贝叶斯法分析发现了在有鳞目内蜥蜴亚目与蛇亚目的姐妹群关系，提供了支持蜥蜴类单系性的新证据。获得了壁虎科33个属、鳞脚虎科和睑虎科各2个属的线粒体12S rRNA基因全序列和核C-mos基因部分序列，推测了壁虎类各属间的相互关系。测定了蛇类4个科各1种蛇的线粒体基因组全序列，把蛇类的线粒体基因排列归纳为6个类型。蛇类主要科间的系统发生关系与线粒体基因排列相一致。