本课题将以小鲵科现记载的9属，侧重于中国分布的物种及居群，尤其是东及东北地区分布的小鲵属等4属为重点研究材料，以居群为基本研究单元，采用mtDNA测序、染色体、形态等多层次技术手段，运用分子系统学、支序系统学、分子系统地理学的数据分析方法，采取从种下到种及以上、分区域或分属种、从局部进而到全科的构思，将种内水平的微进化与种上水平的大进化有机结合：①全面系统地阐明小鲵科动物的系统发育关系；②在此基础

亚洲特有小鲵科动物是现生有尾两栖类中最原始的类群。本课题突破性获得原鲵属活体标本，使研究材料涵盖了小鲵科现记载的全部10属，研究主要采用mtDNA全基因组及多个核基因测序、染色体核型、外部形态及骨骼解剖等多层次技术手段，运用分子系统学、支序系统地理学的分析方法，重建系统发育并追朔格局成因：①通过多重佐证，澄清了该科从种下到种上、甚至更高阶元的诸多分类问题；②基于2kb的mtDNA序列重建的小鲵属23种的分子树分为7支，日本及韩国的5支与台湾岛支、中国华东支在树上相互交错，推测中国华东、中国东北及朝鲜半岛与日本诸岛在地史过程中有过多次相互连接；③山溪鲵属的联合基因树由5支构成，其物种间的替代式格局与现有的山系、水系格局没有明显的相关性，推测其格局形成早于晚中新世的青藏高原抬升事件，且呈南北向的扩散趋势；④联合基因树表明，小鲵科现生类群为一单系；支持小鲵科北方起源的观点；早第三纪中亚荒漠化将北鲵属及Paradactylodon属与其它类群分离；青藏高原抬升使中国西部地区成为次级分化中心，山溪鲵属因高原切向移动而与巴鲵属和原鲵及拟小鲵属分离；巴鲵属和原鲵及拟小鲵属则由长江阻隔分离。