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基于耐高温mutS蛋白、pfu DNA聚合酶、dU修饰寡核苷酸探针的SNP检测技术

基于耐高温mutS蛋白、pfu DNA聚合酶、dU修饰寡核苷酸探针的SNP检测技术
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  • 批准号:30700131
  • 批准年度: 2007年
  • 学科分类:代谢生物化学(C0507) |
  • 项目负责人:刘喜朋
  • 负责人职称:副教授
  • 依托单位:上海交通大学
  • 资助金额:17万元
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 研究期限:2008年01月01日 至 2010年12月31日
  • 中文关键词: mutS;、pfu DNA;、dU;寡核苷酸探针;SNP
  • 英文关键词:暂无数据

项目摘要

中文摘要

与含dU碱基双链DNA结合,pfu DNA聚合酶不能催化DNA延伸反应。如果dU处于错配碱基附近,MutS蛋白与DNA中错配碱基的结合将阻止pfu DNA聚合酶与含dU的DNA结合,使pfu DNA聚合酶能够催化DNA延伸反应。利用这一特征,建立独特的SNP检测技术。进行PCR循环的SNP检测反应溶液含有dU修饰的寡核苷酸探针,单链DNA检测目标,报告DNA模板及其上下游引物,MutS蛋白和pfu DNA聚合酶。若寡核苷酸探针与检测目标完全配对,MutS不能与杂合分子结合,含dU碱基的DNA将与pfu DNA聚合酶结合,阻止报告DNA模板的PCR扩增反应;反之,含有错配碱基的杂合分子能够与MutS结合,不能与dU双链DNA结合的pfu DNA聚合酶可以催化报告基因PCR扩增。利用这种技术进行HLA分型,证实本法检测结果准确、操作简便、灵敏度高、与现有实验室方法和设备兼容,具有广阔应用前景。

结题摘要

与含dU碱基双链DNA结合,pfu DNA聚合酶不能催化DNA延伸反应。如果dU处于错配碱基附近,MutS蛋白与DNA中错配碱基的结合将阻止pfu DNA聚合酶与含dU的DNA结合,使pfu DNA聚合酶能够催化DNA延伸反应。利用这一特征,建立独特的SNP检测技术。进行PCR循环的SNP检测反应溶液含有dU修饰的寡核苷酸探针,单链DNA检测目标,报告DNA模板及其上下游引物,MutS蛋白和pfu DNA聚合酶。若寡核苷酸探针与检测目标完全配对,MutS不能与杂合分子结合,含dU碱基的DNA将与pfu DNA聚合酶结合,阻止报告DNA模板的PCR扩增反应;反之,含有错配碱基的杂合分子能够与MutS结合,不能与dU双链DNA结合的pfu DNA聚合酶可以催化报告基因PCR扩增。利用这种技术进行HLA分型,证实本法检测结果准确、操作简便、灵敏度高、与现有实验室方法和设备兼容,具有广阔应用前景。

评估说明

    国家自然科学基金项目“基于耐高温mutS蛋白、pfu DNA聚合酶、dU修饰寡核苷酸探针的SNP检测技术”发布于爱科学iikx,并永久归类于相关科学基金导航中,仅供广大科研工作者查询、学习、选题参考。国科金是根据国家发展科学技术的方针、政策和规划,以及科学技术发展方向,面向全国资助基础研究和应用研究,发挥着促进我国基础研究源头创新的作用。国科金的真正价值在于它能否为科学进步和社会发展带来积极的影响。

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