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铁高效基因型苹果属小金海棠缺铁诱导相关基因的表达与网络分析

铁高效基因型苹果属小金海棠缺铁诱导相关基因的表达与网络分析
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  • 批准号:30800741
  • 批准年度: 2008年
  • 学科分类:果树学(C1501) |
  • 项目负责人:肖海华
  • 负责人职称:副教授
  • 依托单位:中国农业大学
  • 资助金额:10万元
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 研究期限:2009年01月01日 至 2009年12月31日
  • 中文关键词: 基因型;苹果;金海棠;缺铁;网络
  • 英文关键词:暂无数据

项目摘要

中文摘要

随着功能基因组研究的开展,基因调控网络研究成为功能基因组研究的重要内容。本研究旨在应用基因芯片技术,研究受缺铁诱导相关基因在苹果属小金海棠不同铁营养浓度下不同组织表达情况进行分析,并结合测定缺铁性状(包括根际pH变化、根构型变化以及植物体内铁含量等)性状进行统计学分析,采用Bayesian Network 软件包构建这些基因的贝叶斯互作网络,得出一个影响铁代谢的多基因效应的互作网络。影响铁代谢的多基因效应的互作网络有利于我们从多基因互作角度研究铁高效基因型苹果树体内铁的代谢,储存和分布。对整个网络的研究可以使我们整体全面的角度去认识研究铁在体内的调节机制,并且能够从中找到在这个网络中对铁代谢起主导作用的一个或多个基因(称为节点基因),为生物技术育种改善果树铁营养提供良好的基础。

结题摘要

利用GenBank数据库搜索到了39个与铁营养代谢相关的基因,并对这些基因进行了生物信息学分析,同时还结合筛选小金海棠缺铁基因表达文库,筛选出了200多个受缺铁诱导加强表达的铁营养代谢相关基因,综合以上基因的生物学信息,挑选出了40个代表性基因设计基因芯片的探针。对缺铁处理和正常铁浓度条件下培养的小金海棠进行了缺铁相关性状进行分析,结果表明,在受到缺铁胁迫时,小金海棠生长介质pH值呈现下降现象,而且在前三天下降幅度较大,从最初的6.50降到了6.19。缺铁胁迫与正常供铁的小金海棠相比根系Fe(Ⅲ)还原酶活性明显提高。正常铁营养时,根系Fe(Ⅲ)还原酶活性较低,其值在140~200nmol/g.FW.2h之间, 而低铁胁迫条件下,根系Fe(Ⅲ)还原酶活性大大增强,其值在420~753 nmol/g.FW.2h之间。

评估说明

    国家自然科学基金项目“铁高效基因型苹果属小金海棠缺铁诱导相关基因的表达与网络分析”发布于爱科学iikx,并永久归类于相关科学基金导航中,仅供广大科研工作者查询、学习、选题参考。国科金是根据国家发展科学技术的方针、政策和规划,以及科学技术发展方向,面向全国资助基础研究和应用研究,发挥着促进我国基础研究源头创新的作用。国科金的真正价值在于它能否为科学进步和社会发展带来积极的影响。

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