多年生簇毛麦是小麦族植物中的一个稀有物种，是普通小麦遗传改良的珍贵基因资源，我们在对多年生簇毛麦基因资源系统研究的基础上，在国内外率先开展了利用染色体工程方法,将多年生簇毛麦的优异基因渗入小麦的研究,创制了一批小麦-多年生簇毛麦抗条锈病渐渗系。本研究拟对导入多年生簇毛麦染色体小片段的渐渗系，进行抗条锈病基因的遗传分析，结合分子标记进行抗性基因的染色体定位与遗传图谱的绘制，阐明抗性基因的遗传表达行为。同时建立辅助育种选择的分子标记，为聚合优异基因，培育抗病、优质、高产小麦新品种奠定基础。

通过多年生簇毛麦与簇毛麦属其它二倍体物种的基因组重复序列、染色体组比较、醇溶蛋白基因家系分析，发现簇毛麦属具有较大的遗传多样性，其基因资源值得进一步开发；分离了5个多年生簇毛麦特异重复序列，其中pDb12H成功地用于跟踪多年生簇毛麦和二倍体簇毛麦染色质向小麦中导入过程，发现该序列可以用于跟踪中间偃麦草的一个染色体组，揭示了簇毛麦与中间偃麦草的染色体组有较大的同源性。染色体工程方法获得了6份小麦-多年生簇毛麦附加系、代换系和抗条锈病渐渗系，抗条锈病基因的遗传分析和染色体特异PCR标记分析，表明抗病品系V9803抗条锈病基因来源于多年生簇毛麦，位于第2同源群上，获得了与抗性基因紧密连锁的EST-SSR分子标记Xmag3318-318 和Xmag3318-263，表明抗性基因位于2DL近中部区域，为聚合优异基因，培育抗病、高产小麦新品种奠定基础。