藏羚是世界上最濒危的野生动物之一，近几十年来藏羚栖息地退缩问题也日趋显著，逐渐形成若干隔离种群。本项目将基于种群遗传学理论，利用线粒体DNA控制区（D-Loop）与种群系统进化、地质历史密切相关且研究基础最为深厚的线粒体DNA细胞色素b开展研究，着重对现存新疆、青海、西藏的四个主要地理种群的遗传结构进行比较分析，弄清藏羚各种群间遗传分化现状，探讨栖息地片段化对种群基因交流造成的影响和长距离迁移在藏羚种群交流中可能存在的作用，并结合目前青藏高原环境变迁和建设开发现状，分析人类活动对藏羚种群繁衍生息可能造成的影响。为科学保护这一珍稀物种资源提供理论依据，同时为未来研究该种群遗传多样性与环境变迁的关系提供珍贵的比较资料。

藏羚(Pantholops hodgsonii)是世界上最濒危的野生动物之一，为青藏高原特有种，分布在青藏高原及其临近方圆约95万平方公里的区域内，东至黄河源头鄂陵湖地区，西可达印度拉达克，绝大部分位于中国境内。在我国主要分布在青海、四川西北部、甘肃南部、西藏及新疆的阿尔金山地区。在大约一个世纪以前藏羚的几个种群呈连续分布，而近几十年来藏羚栖息地近几十年来藏羚栖息地退缩问题也日趋显著，逐渐形成若干隔离种群。本研究对采自新疆、西藏和青海的藏羚主要种群的358个个体进行了种群遗传结构分析，线粒体细胞色素b和D-loop区DNA多态性分析均表明目前各藏羚种群的遗传多样性水较高，各个隔离地理种群间基因流强度与各种群间的地理阻隔和距离均无显著相关。研究结果表明：目前藏羚的遗传现状仍比较健康，对其线粒体单倍型的系统进化分析未发现显著的种群地理结构；尽管藏羚冬季栖息地可能存在隔离，但藏羚不同地理种群间仍存在较强的基因交流，这可能是迁移过程中在产羔地部分个体发生交换而增加了种群间基因交流的机会。因此藏羚的迁移有可能促进其种明种群间基因交流，而有效保护产羔地和迁移路线至关重要。