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宁夏回族人群先天性唇腭裂与IRF6,MSX1基因SNP相关性研究

宁夏回族人群先天性唇腭裂与IRF6,MSX1基因SNP相关性研究
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  • 批准号:30660198
  • 批准年度: 2009年
  • 学科分类:口腔颌面部遗传性疾病和发育畸形及软组织缺损修复(H1403) |
  • 项目负责人:黄永清
  • 负责人职称:教授
  • 依托单位:宁夏医科大学
  • 资助金额:20万元
  • 项目类别:地区科学基金项目
  • 研究期限:2006年12月31日 至 2009年12月30日
  • 中文关键词: 回族;先天性唇腭裂;IRF6,MSX1;SNP;相关性研究
  • 英文关键词:NSCL/P;SNP;IRF6;MSX1;FGF 3

项目摘要

中文摘要

先天性唇腭裂(CLP)是人类最常见的出生缺陷之一。本课题收集了206个核心家系(患者+双亲)以及174个正常对照组患儿,应用传递不平衡检验(TDT)和病例-对照方法,研究了IRF6、 MSX1和FGF3三个候选基因SNPs与非综合征型唇裂伴或不伴腭裂(NSCL/P)相关性。应用病例-对照设计,对环境暴露因素和IRF6、MSX1基因多态性与NSCL/P的关系进行单因素分析和多因素Logistic 回归分析, 研究哪些暴露因素是NSCL/P发生的显著性危险因素。在中国西部人群中,IRF6基因rs2235375、rs2235371(V274I)、rs642961、rs4844880四个SNP位点和MSXI基因CA重复序列多态性及 FGF3基因rs4980700、 rs4631909多态位点与NSCL/P的发病存在相关性,回汉族患者之间没有差异;MSX1基因的Q147I、rs3821949和rs12532 三个SNP位点与NSCL/P的发生无相关性;研究证实母亲孕早期患病史、母亲流产史、母亲孕早期服药史、父亲吸烟史与NSCL/P发病密切相关,母亲孕期维生素补充与NSCL/P的发病呈负相关。

英文摘要

Non-syndromic cleft lip with or without palate (NSCL/P) is a complex or multifactorial disease which has a high prevalence, 1.62/1000 live births, in China.We investigated the association between IRF6, MSX1 and FGF3 genes variants and NSCL/P, using both case-parent trio and case-control designs on samples from western China (in Ningxia population and western Chinese populations). Our study group consisted of 332 persons with NSCL/P, their parents, and 174 control individuals. On the basis of both genetic and environmental factors contribute to the NSCL/P, using the case-control study method, we further investigate the effects of the environmental exposure and IRF6, MSX1 gene polymorphisms to NSCL/P.Multifactor Logistic regression was used to analyses the results of investigation and detection. We found strong evidence of over- and under-transmission of the C allele (the Val allele) at rs2235371, and the C allele at rs2235375 in cleft case-parent trios (P = 0.013 and P = 0.000, respectively). There were significant differences in the frequency distributions of both genotypes and alleles when cases were compared with control infants at rs2235371 and rs2235375. Five specific haplotypes showed significant over- and under-transmission. The polymorphism of rs642961 and rs4844880 in IRF6 gene is associated with NSCL/

结题摘要

先天性唇腭裂(CLP)是人类最常见的出生缺陷之一。本课题收集了206个核心家系(患者+双亲)以及174个正常对照组患儿,应用传递不平衡检验(TDT)和病例-对照方法,研究了IRF6、 MSX1和FGF3三个候选基因SNPs与非综合征型唇裂伴或不伴腭裂(NSCL/P)相关性。应用病例-对照设计,对环境暴露因素和IRF6、MSX1基因多态性与NSCL/P的关系进行单因素分析和多因素Logistic 回归分析, 研究哪些暴露因素是NSCL/P发生的显著性危险因素。在中国西部人群中,IRF6基因rs2235375、rs2235371(V274I)、rs642961、rs4844880四个SNP位点和MSXI基因CA重复序列多态性及 FGF3基因rs4980700、 rs4631909多态位点与NSCL/P的发病存在相关性,回汉族患者之间没有差异;MSX1基因的Q147I、rs3821949和rs12532 三个SNP位点与NSCL/P的发生无相关性;研究证实母亲孕早期患病史、母亲流产史、母亲孕早期服药史、父亲吸烟史与NSCL/P发病密切相关,母亲孕期维生素补充与NSCL/P的发病呈负相关。

评估说明

    国家自然科学基金项目“宁夏回族人群先天性唇腭裂与IRF6,MSX1基因SNP相关性研究”发布于爱科学iikx,并永久归类于相关科学基金导航中,仅供广大科研工作者查询、学习、选题参考。国科金是根据国家发展科学技术的方针、政策和规划,以及科学技术发展方向,面向全国资助基础研究和应用研究,发挥着促进我国基础研究源头创新的作用。国科金的真正价值在于它能否为科学进步和社会发展带来积极的影响。

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