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中国传统发酵乳制品中乳酸菌基因组DNA分子多态性分析研究

中国传统发酵乳制品中乳酸菌基因组DNA分子多态性分析研究
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  • 批准号:30660135
  • 批准年度: 2009年
  • 学科分类:兽医内科学(C180802) |
  • 项目负责人:孙天松
  • 负责人职称:教授
  • 依托单位:内蒙古农业大学
  • 资助金额:20万元
  • 项目类别:地区科学基金项目
  • 研究期限:2007年01月01日 至 2009年12月31日
  • 中文关键词: 发酵乳制品;乳酸菌;基因组;DNA;多态性
  • 英文关键词:Lactobacillus;Genetic diversity; Molecular markers;AFLP;ERIC-PCR

项目摘要

中文摘要

本课题通过优化标记体系,确立了适用于乳杆菌的ERIC-PCR和AFLP两种分子标记的具体实验方法,完成对来自不同地区自然发酵乳中的乳杆菌进行遗传多样性分析。1 对115株乳杆菌西藏分离株进行多样性研究。ERIC-PCR以同源率0.80为分界点,被分为14个群。AFLP以同源率0.85为分界点,菌被分成4个AFLP群。2 对81株乳杆菌新疆分离株进行多样性研究。ERIC-PCR以同源率0.76为分界点,被分为4个群。AFLP以同源率0.80为分界点,被分为6个群。3 对69株乳杆菌云南分离株进行多样性研究。ERIC-PCR以同源率0.80为分界点,被分为4个群。AFLP以同源率0.89为分界点,被分成5个AFLP群。4 对西藏、新疆和云南三个地区的105株瑞士乳杆菌分离株进行遗传多样性分析。以同源率0.80为分界点,分别形成7个ERIC-PCR群和5个AFLP群。并且不同地区分离株形成不同的类群。通过分析,两种分子标记技术都具有高的遗传多态性,可用于乳杆菌基因组水平的多态性分析。

英文摘要

In this study, ERIC-PCR and AFLP molecular markers which were suitable for Lactobacillus were established. The genetic diversity of 316 Lactobacillus isolated from different regions traditional fermented dairy products was completed using by the two methods.1. The genetic diversity of 115 Lactobacillus isolated from Tibet was dedected. The tested strains were clustered into 14 groups by ERIC-PCR at similarity level of 0.80, and were clustered into 4 groups by AFLP at similarity level of 0.85.2. The genetic diversity of 81 Lactobacillus isolated from Xinjiang was dedected. The tested strains were clustered into 4 groups by ERIC-PCR at similarity level of 0.76, and were clustered into 6 groups by AFLP at similarity level of 0.80.3. The genetic diversity of 69 Lactobacillus isolated from Yunnan was dedected. The tested strains were clustered into 4 groups by ERIC-PCR at similarity level of 0.80, and were clustered into 5 groups by AFLP at similarity level of 0.89.4. The genetic diversity of 105 Lactobacillus helveticus isolated from Tibet,Xingjiang, and Yunnan were analyzed. The tested lactobacillus helveticus were clustered into 7 ERIC-PCR groups and 5 AFLP groups at the similarity level of 0.80, respectively. And the strains isolated from different geographic origin could be divided into different group by tw

结题摘要

本课题通过优化标记体系,确立了适用于乳杆菌的ERIC-PCR和AFLP两种分子标记的具体实验方法,完成对来自不同地区自然发酵乳中的乳杆菌进行遗传多样性分析。1 对115株乳杆菌西藏分离株进行多样性研究。ERIC-PCR以同源率0.80为分界点,被分为14个群。AFLP以同源率0.85为分界点,菌被分成4个AFLP群。2 对81株乳杆菌新疆分离株进行多样性研究。ERIC-PCR以同源率0.76为分界点,被分为4个群。AFLP以同源率0.80为分界点,被分为6个群。3 对69株乳杆菌云南分离株进行多样性研究。ERIC-PCR以同源率0.80为分界点,被分为4个群。AFLP以同源率0.89为分界点,被分成5个AFLP群。4 对西藏、新疆和云南三个地区的105株瑞士乳杆菌分离株进行遗传多样性分析。以同源率0.80为分界点,分别形成7个ERIC-PCR群和5个AFLP群。并且不同地区分离株形成不同的类群。通过分析,两种分子标记技术都具有高的遗传多态性,可用于乳杆菌基因组水平的多态性分析。

评估说明

    国家自然科学基金项目“中国传统发酵乳制品中乳酸菌基因组DNA分子多态性分析研究”发布于爱科学iikx,并永久归类于相关科学基金导航中,仅供广大科研工作者查询、学习、选题参考。国科金是根据国家发展科学技术的方针、政策和规划,以及科学技术发展方向,面向全国资助基础研究和应用研究,发挥着促进我国基础研究源头创新的作用。国科金的真正价值在于它能否为科学进步和社会发展带来积极的影响。

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