研究非可控性炎症向癌症转化的分子机制及调控规律是一个十分重要的科学问题，为理解癌症的发病机理提供了新的线索，也为癌症的早期诊断、治疗以及干预措施提供了新的思路。本课题通过融合不同组学数据，如基因组数据（SNP）、转录组数据（mRNA、miRNA）、调控数据（TF、miRNA）、互作组数据（蛋白质互作）、功能数据（Gene Ontology）、通路数据等，从系统生物学的角度，基于融合生物学资源与优化策略，构建炎症与癌症相关的调控网络与通路，研究炎症向癌症转化的全局协同调控网络及其调控规律，识别恶性转化的关键节点及重要功能通路。预期研究结果可以帮助系统地理解炎症向癌症转化的分子机制及其转化规律，并为癌症的靶向治疗开辟新的途径。

　　项目按计划完成了炎症与癌症相关的调控网络与通路构建，并应用于评价非可控性炎症向癌症转化的分子机制及调控规律，包括：（1）DNA高甲基化与下调基因有显著的相关性，而低甲基化与上调基因的相关性较弱，且可能与慢性炎症相关联。（2）在不同癌型间基因启动子高、低甲基化分别有高度一致的功能，但是这两组基因倾向于富集与癌症相关的不同功能。（3）结肠炎患者在结肠癌相关功能中具有与结肠癌相似的基因表达改变，这对从结肠炎过度到结肠癌的转化提供了暗示。另外这两种疾病中，少部分基因相对于正常样本差异改变方向相反，并且这些基因与结肠癌相关功能关联，揭示这种相反的调节可能是结肠炎到结肠癌的转化的关键。（4）SM2miR是一个小分子对miRNA表达调节的相当全面的数据库，它促进了对miRNA的靶向治疗。（5）另外还介绍了一种基于miRNA靶向调节异常网络（MTDN）的方法，揭示新的疾病相关的miRNA。　　本项目已发表论文34篇(SCI收录28篇)；本项目的研究成果可以帮助系统地理解炎症向癌症转化的分子机制及其转化规律，并为癌症的靶向治疗开辟新的途径。