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基于全基因组重测序研究报春苣苔属的物种形成与适应性分化

基于全基因组重测序研究报春苣苔属的物种形成与适应性分化
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  • 批准号:31700177
  • 批准年度: 2017年
  • 学科分类:植物系统发生(C020301) |
  • 项目负责人:刘苹
  • 负责人职称:博士后
  • 依托单位:中国科学院华南植物园
  • 资助金额:27万元
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 研究期限:2018年01月01日 至 2020年12月31日
  • 中文关键词: 全基因组重测序;报春苣苔属;物种;适应性
  • 英文关键词:speciation;gene flow;natural selection;divergence time;genetic differentiation

项目摘要

中文摘要

喀斯特特有植物是我国植物多样性和特有性的重要组成部分,但目前对喀斯特植物多样性的起源与演化,尤其是对物种形成机制和适应性分化的研究非常少。报春苣苔属物种多样性丰富,且多为地理隔离的小种群,有清晰的种群边界。喀斯特异质生境为该属植物的分化提供了强大的自然选择压力,因此报春苣苔属植物是研究喀斯特植物多样性形成与维持机制的理想材料。随着怀集报春苣苔(Primulina huaijiensis)基因组组装的完成,从全基因组水平研究喀斯特植物的物种形成机制和适应性分化得以顺利开展。本研究拟以报春苣苔属4个物种的10个群体为实验材料,基于全基因组重测序获得海量的SNP分子标记,通过分析物种的遗传分化、物种边界、基因流和重建物种分化历史来探索喀斯特植物物种形成机制,并同时通过选择性消除分析定位适应性分化相关基因来探讨喀斯特特殊生境中报春苣苔属植物适应性分化的遗传基础。

英文摘要

Karst plants constitute a crucial part of plant diversity and peculiarity in China. However, few of previous studies have focused on the origin and evolution of plant diversity in karsts, especially for the mechanisms underlying the speciation and adaptive divergence. The genus Primulina harbored high level of species richness and most of which are geographically isolated with clear species boundaries. The heterogeneous habitats of karst result in strong natural selection pressure, which confer the Primulina as an ideal system to study the mechanism underlying the diversification of karst species. The successful assembly of Primulina huaijiensis genome provide us opportunity to address the mechanism of speciation and adaptive divergence of karst plants at the whole genome level. In this study, we plan to sequence the whole genomes of 10 populations from four Primulina species. Through the comparative analyses of genetic differentiation, species boundary, gene flow, and demographic history, our study might be able to shed light on the speciation model of karst plants. With further analyses focusing on the genome-wide scanning of selection, we are hopeful to reveal the genetic basis of adaptive divergence among Primulina species.

评估说明

    国家自然科学基金项目“基于全基因组重测序研究报春苣苔属的物种形成与适应性分化”发布于爱科学iikx,并永久归类于相关科学基金导航中,仅供广大科研工作者查询、学习、选题参考。国科金是根据国家发展科学技术的方针、政策和规划,以及科学技术发展方向,面向全国资助基础研究和应用研究,发挥着促进我国基础研究源头创新的作用。国科金的真正价值在于它能否为科学进步和社会发展带来积极的影响。

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