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NUDT21在肝癌细胞中引起的poly(A)位点改变及其抑癌机理的研究

NUDT21在肝癌细胞中引起的poly(A)位点改变及其抑癌机理的研究
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  • 批准号:31671299
  • 批准年度: 2016年
  • 学科分类:遗传与变异(C060406) |
  • 项目负责人:赵小东
  • 负责人职称:研究员
  • 依托单位:上海交通大学
  • 资助金额:62万元
  • 项目类别:面上项目
  • 研究期限:2017年01月01日 至 2020年12月31日
  • 中文关键词: NUDT21;引起;poly(A);位点;改变
  • 英文关键词:Alternative polyadenylation;3' end sequencing;NUDT21 gene;Epigenetic modification

项目摘要

中文摘要

选择性多聚腺苷酸化(APA)是基因表达的一种重要转录后调控方式,参与细胞分化、免疫激活和肿瘤形成等生物学过程。最近研究发现剪切因子元件NUDT21影响恶性胶质瘤细胞APA模式并发挥肿瘤抑制功能。而NUDT21对其他肿瘤APA的影响及其功能仍有待阐明。我们前期工作发现肝癌组织和肝癌细胞系中NUDT21表达明显下调,抑制NUDT21的表达增强肝癌细胞的增殖、迁移和克隆形成能力,提示NUDT21 在肝癌细胞中发挥肿瘤抑制作用。本项目拟通过我们研发的3T-seq技术,在含有不同NUDT21表达水平的肝癌细胞中开展全基因组范围的APA位点研究,明确NUDT21对肝癌细胞APA的影响,并阐明NUDT21如何通过改变相关基因poly(A)选择性使用和3’UTR而发挥其肿瘤抑制的功能。这一工作不仅可以推进APA和肿瘤关系的理解,而且将对于探索NUDT21在不同肿瘤中所发挥的作用提供借鉴。

英文摘要

Alternative polyadenylation (APA) is an important post-transcriptional regulation for gene expression. APA is implicated in cellular differentiation, immune activation and tumor formation. A recent report revealed cleavage factor component NUDT21 modulates APA pattern in glioblastoma cells and suppresses glioblastoma tumorigenicity. However, it remains to be elucidated that whether NUDT21 has an effect on APA pattern in other types of cancer cells. In our pilot work we observed NUDT21 is down-regulated in both liver cancer tissue and hepatocellular carcinoma (HCC) cells. Suppression of NUDT21 promotes proliferation, migration and clone formation of HCC cells, suggesting it functions as a tumor suppressor. With 3T-seq developed by ourselves, in this project we will perform a genome-wide APA profiling analysis in HCC cells with various expression levels of NUDT21. We will investigate the effect of NUDT21 on APA selection and how it exert the tumor suppressor function on HCC cells by modulating APA usage and 3’UTR. This work will improve the understanding of relation between APA and tumor, and provide some insights for characterizing NUDT21 function in other types of cancer.

评估说明

    国家自然科学基金项目“NUDT21在肝癌细胞中引起的poly(A)位点改变及其抑癌机理的研究”发布于爱科学iikx,并永久归类于相关科学基金导航中,仅供广大科研工作者查询、学习、选题参考。国科金是根据国家发展科学技术的方针、政策和规划,以及科学技术发展方向,面向全国资助基础研究和应用研究,发挥着促进我国基础研究源头创新的作用。国科金的真正价值在于它能否为科学进步和社会发展带来积极的影响。

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