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Circular RNA作为竞争性内源RNA在癌症转移中的调控网络研究

Circular RNA作为竞争性内源RNA在癌症转移中的调控网络研究
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  • 批准号:31671375
  • 批准年度: 2016年
  • 学科分类:生物数据整合与生物大数据(C060703) |
  • 项目负责人:曲红
  • 负责人职称:副教授
  • 依托单位:北京大学
  • 资助金额:60万元
  • 项目类别:面上项目
  • 研究期限:2017年01月01日 至 2020年12月31日
  • 中文关键词: Circular RNA;竞争性;内源;RNA;网络
  • 英文关键词:human;complex network;data mining;network analysis;systems biology

项目摘要

中文摘要

本申请将着重研究circular RNA (circRNA) 通过竞争性结合miRNA对癌症转移相关基因的调控影响。我们前期研究发现癌症转移抑制基因受到miRNA的调控并在卵巢癌转移样本中发生差异表达。本申请中我们将结合前期研究结果,利用TCGA泛癌症基因组学数据及收集到的癌症转移促进基因和抑制基因,构建circRNA与miRNA相互作用介导的癌症转移基因调控网络及生物信息学网络分析平台。通过系统网络分析,探索癌症转移中circRNA对转移促进基因和抑制基因的调控机制,发现重要的circRNA及其影响的miRNA和癌症转移基因,检测这些circRNA在结直肠癌肿瘤组织中的表达水平,阐明circRNA在癌症转移中的效应途径,并探讨circRNA与患者临床参数之间的关系及与患者生存预后的相关性。

英文摘要

By focusing on the circRNA-based cancer metastasis regulatory network, we aim to identify the key circRNA and miRNA-mediated regulatory motifs, which may are potential diagnostic or predictive biomarkers in cancers..This proposal has three aims: .Aim 1) Large-scale inference of competing endogenous circRNAs as the sponge to neutralize the inhibitory effects of miRNAs by using TCGA pan-cancer data and construction of circRNA and miRNA-mediated human cancer regulatory network (CMN);.Aim 2) Focusing on cancer metastasis, we will intersect our curated metastasis promoting and suppressing genes to the CMNs from Aim 1 to construct circRNA and miRNA-mediated human cancer metastasis regulatory network (CMMN) and to prioritize the key circRNAs from the metastasis-specific regulatory networks based on topological importance;.Aim 3) For proof-of-concept, we will test the top candidate circRNAs and their relevant miRNAs and targeting metastasis-related genes in colorectal cancer tissue samples. By further exploration of the relationship between the key circRNAs and the clinical information such as survival periods, we will build an effective strategy to develop the circRNA-based biomarkers for diagnosis in colorectal cancer.

评估说明

    国家自然科学基金项目“Circular RNA作为竞争性内源RNA在癌症转移中的调控网络研究”发布于爱科学iikx,并永久归类于相关科学基金导航中,仅供广大科研工作者查询、学习、选题参考。国科金是根据国家发展科学技术的方针、政策和规划,以及科学技术发展方向,面向全国资助基础研究和应用研究,发挥着促进我国基础研究源头创新的作用。国科金的真正价值在于它能否为科学进步和社会发展带来积极的影响。

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