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急性脑梗死血瘀证与其基因共表达网络动态关联模型研究

急性脑梗死血瘀证与其基因共表达网络动态关联模型研究
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  • 批准号:81673833
  • 批准年度: 2016年
  • 学科分类:中医药学研究新技术和新方法(H2903) |
  • 项目负责人:刘骏
  • 负责人职称:副研究员
  • 依托单位:中国中医科学院中医临床基础医学研究所
  • 资助金额:57万元
  • 项目类别:面上项目
  • 研究期限:2017年01月01日 至 2020年12月31日
  • 中文关键词: 急性脑梗死血瘀证;网络;关联
  • 英文关键词:Acute cerebral infarction ;Xueyuzheng;Genes co-expression network;Dynamic network;Partial least squa

项目摘要

中文摘要

证候具有“动态时空”属性,其宏观的动态改变必然有微观组学网络系统与之相对应。然而目前这种对应关系的研究多为对横断面的静态定性分析,尚未开展证候与其对应基因网络的动态关联定量分析。本研究在前期建立的血瘀证证候动态变化的时效定量模型基础上,依托丹红注射液治疗急性脑梗死血瘀证3个时间点的mRNA组学数据(0天,第14天,第90天),构建急性脑梗死血瘀证差异基因共表达动态网络,采用动态频繁子图法挖掘基因共表达动态网络的核心动态模块,然后采用偏最小二乘差异网络分析法结合前期血瘀证证候时效动力学模型,建立急性脑梗死血瘀证与基因共表达网络核心动态模块的定量关联,通过GO功能富集和KEGG通路富集分析核心动态模块,揭示证候动态变化的转录调控机制,从而从微观层面诠释证候随时间改变的动态属性特征。

英文摘要

Zhenghou has temporal-spatial dynamic property,which macroscopic dynamic change should be associated with the corresponding microscopic transcriptomic network system. However, recent studies on this relationship mostly were the static cross-section analysis, rather than the quantitative analysis of dynamic association. Previously, We had established a T-pharmacodynamics model of Xueyu Zheng. This study continue to construct a quantitative dynamic model on the relationship between the acute cerebral infarction (Xueyu Zheng) and the dynamic differential gene co-expression network based on the data from an ongoing trial on Danhong injection for the treatment of acute cerebral infarction (Xueyu Zheng). Firstly, using the temporal data of mRNA omics data on Day 0,Day 14 and Day 90, we will build a dynamic gene co-expression network of acute cerebral infarction (Xueyu Zheng), and obtain the core dynamic module using the analysis of dynamic frequent subgraph. Secondly, we will establish the quantitative correlation model between the symptoms Score of acute cerebral infarction (Xueyu Zheng) and the gene expression of the core dynamic module based on the previous T-pharmacodynamics model of Xueyu Zheng using the differential network analysis of the partial least squares (PLS)regression. Finally, we will analysis the molecular function of the core dynamic module through GO and KEGG enrichment anlysis to reveal the molecular mechanism of transcription regulation for the dynamic property of acute cerebral infarction (Xueyu Zheng). Our study will provide a method on the annotation for the dynamic property of Zhenghou.

评估说明

    国家自然科学基金项目“急性脑梗死血瘀证与其基因共表达网络动态关联模型研究”发布于爱科学iikx,并永久归类于相关科学基金导航中,仅供广大科研工作者查询、学习、选题参考。国科金是根据国家发展科学技术的方针、政策和规划,以及科学技术发展方向,面向全国资助基础研究和应用研究,发挥着促进我国基础研究源头创新的作用。国科金的真正价值在于它能否为科学进步和社会发展带来积极的影响。

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