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PPARA相关rSNP的组学筛查及其在高胆固醇血症中的协同致病机制

PPARA相关rSNP的组学筛查及其在高胆固醇血症中的协同致病机制
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  • 批准号:81660041
  • 批准年度: 2016年
  • 学科分类:循环系统遗传性疾病(H0202) |
  • 项目负责人:邓立彬
  • 负责人职称:副教授
  • 依托单位:南昌大学
  • 资助金额:40万元
  • 项目类别:地区科学基金项目
  • 研究期限:2017年01月01日 至 2020年12月31日
  • 中文关键词: PPARA;rSNP;组学;高胆固醇血症;致病
  • 英文关键词:Hypercholesterolemia;regulatory SNP;PPAR signaling pathway;Transcription factor;hepatocyte

项目摘要

中文摘要

高胆固醇血症(Hypercholesterolemia, HC)是一种以血浆总胆固醇和低密度脂蛋白胆固醇明显增高为特征的复杂疾病,是心血管病的重要危险因素。目前已知HC与遗传因素有关。组学筛查表明,人群胆固醇性状关联位点多数是调控性单核苷酸多态性(regulatory SNP,rSNP),可影响基因表达调控。PPARA作为重要的脂质感受器是Fibrate类降血脂的作用靶点。我们的研究提示,rSNP可影响PPARA与其靶基因协同过程,从而导致HC。据此,本项目拟整合多层次组学数据,系统预测PPARA有关rSNP;在建立HC遗传资源库的基础上,验证PPARA有关rSNP与HC关联;进一步在人群和细胞模型两个层次,探讨rSNP参与多基因协同致病的过程。本项目将完善基于多基因协同的复杂疾病研究方案,揭示HC发生的分子机制,为冠心病的控制提供新思路。

英文摘要

Hypercholesterolaemia (HC) is a complex disorder characterized by raised serum total cholesterol (TC) and LDL cholesterol levels, and associated with an increased risk of atherosclerosis and coronary heart disease. It is a common assumption that HC is caused by genetic factors, environmental factors and the interaction of the two. Based on the genome-wide scanning, more and more rSNP (regulatory SNP) related to cholesterol-trait had been detected. Recently, our group found that rSNP potentially contributed to the dysfunction of gene regulation among PPARA and its’ targets. In this study, we will be focused on construct the cholesterol-trait related genetic regulatory network (GRN) using ChIP-sequencing and RNA microarray resource; as well as a list of rSNP related to HC based on individual SNP-typing data. Most import, the integration of regulatory profiles and genetic map will illuminate the pathogenesis of the HC in population. And, the role of rSNP on cholesterol-trait will be confirmed in HepG2 cell line models. The completion of this project will further clarify the contribution of gene regulation in metabolic dyslipidemia, which will provide a novel health promotion strategy for coronary heart disease.

评估说明

    国家自然科学基金项目“PPARA相关rSNP的组学筛查及其在高胆固醇血症中的协同致病机制”发布于爱科学iikx,并永久归类于相关科学基金导航中,仅供广大科研工作者查询、学习、选题参考。国科金是根据国家发展科学技术的方针、政策和规划,以及科学技术发展方向,面向全国资助基础研究和应用研究,发挥着促进我国基础研究源头创新的作用。国科金的真正价值在于它能否为科学进步和社会发展带来积极的影响。

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