毕氏肠微孢子虫在人兽共患传播中具有重要作用，但有关人与宠物共患传播的遗传学基础尚不清楚，本项目以申请人课题组分离鉴定的人与宠物源毕氏肠微孢子虫分离株为主要研究对象，筛选4～6个多态性基因位点对获取的人与宠物共患毕氏肠微孢子虫进行多位点序列分型和群体遗传结构研究，以确定人与宠物毕氏肠微孢子虫基因型及其分布情况和人与宠物共患传播的遗传变异规律等。研究结果对解析人与宠物共患传播毕氏肠微孢子虫的生物学特性、人与宠物之间毕氏肠微孢子虫的传播动力学和感染来源具有直接意义，同时为我国食源性/水源性暴发病例的监测和溯源提供必要的数据参考和技术支持。

Enterocytozoon bieneusi plays an important role in the zoonotic transmission, but the genetic foundation of zoonotic Enterocytozoon bieneusi between human and pet animals is not known. In this project, the human and pet animal-derived Enterocytozoon bieneusi isolates collected and identified in the present laboratory are as the main research object. Four to six polymorphic gene loci will be selected and be used in the multilocus sequence typing and population genetic structure research for human and pet animal zoonotic Enterocyzoon bieneusi, confirming the human and pet animal-derived Enterocyzoon bieneusi genotypes and their distribution, and the genetic variation pattern of human and pet animal zoonotic Enterocyzoon bieneusi. The data obtained in this project should have direct significance in elucidating the biology, the transmission dynamics between human and pet animals and the infection source of Enterocyzoon bieneusi. Moreover, This project will provide technical support for monitoring and tracing the infection source of foodborne/waterborne outbreak cases in China.

毕氏肠微孢子虫（Enterocytozoon bieneusi，E.bieneusi）是一种人兽共患的肠道原虫，在人兽共患传播中具有重要作用，但有关人与动物共患传播的遗传学基础尚不明确。项目组对我国国内不同地区收集的276份犬和猫粪便样品，基于ITS基因进行E. bieneusi的PCR扩增和测序，总感染率为15.94%（44/276）。犬和猫样品的感染率分别为21.29%（34/158）和8.47%（10/94）。共发现18个E. bieneusi基因型，其中犬感染了5个已报道的基因型（PtEbIX、CM1、Peru8、EbpC、Type IV）和6个新基因型（CD1-6），猫感染了4个已报道的基因型（PtEbIX、BEB6、D和I）和3个新基因型（CC1-3）。种系发育分析显示，5个新基因型CD1、CD2、CD4、CC2和CC3，与EbpC、D、Type IV、Peru8和CM1均位于E. bieneusi基因型的Group1群中，该群为人兽共患的致病性群，提示5个新基因型具有人兽共患特性，有重要的公共卫生意义。本项目组对新疆5个地区10个兔场采集兔粪便样品321份，通过ITS基因位点扩增，毕氏肠微孢子的基因型有BEB8（3）、Type IV (1)、J (4)，其中Type IV 具有人兽共患性。本项目还对新疆马E.bieneusi的分子流行病学情况进行研究，结果表明，所调查区域E.bieneusi的总体感染率为30.9% (81/262)，同时发现不同年龄阶段、以及不同性别马之间E.bieneusi的感染率对比发现无明显差异。整个调查群体中发现了15个已知的基因型（BEB6、 CHG19、CM6、 CM7、 CM8、CS-1、CS-4、D、EpbA、EbpC、G、horse1、horse2、O和Peru8），和4种新的基因型（XJH1-4）；在所有几个基因型当中，有6种基因型存在感染人的报道，分别是BEB6、D、EbpA、EbpC、O和Peru8，其中基因型EbpC最为流行（21/81）。对序列进行系统进化分析发现，14种基因型属于人兽共患基因型，具有潜在的公共卫生意义。E.bieneusi在人与动物之间传播不容忽视。