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慢性胃炎恶性转化的基因调控网络及其关键节点的研究

慢性胃炎恶性转化的基因调控网络及其关键节点的研究
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  • 批准号:91529302
  • 批准年度: 2015年
  • 学科分类:消化系统肿瘤(H1617) |
  • 项目负责人:刘炳亚
  • 负责人职称:研究员
  • 依托单位:上海交通大学
  • 资助金额:250万元
  • 项目类别:重大研究计划
  • 研究期限:2016年01月01日 至 2018年12月31日
  • 中文关键词: 慢性胃炎;恶性;网络;节点
  • 英文关键词:gastric cancer;chronic gastritis;gene regulatory network;inflammation associated cancer

项目摘要

中文摘要

非可治愈性慢性炎症是导致胃癌发生的重要因素之一。因此,了解慢性炎症致癌的机制,从中筛选调控关键基因是临床控制或者干预炎症致癌的实验基础。本项目从临床标本、动物模型和细胞模型三个层面出发,获得慢性胃炎恶性转化各个阶段样本,以激光显微切割获得高纯度细胞样品,以深度测序获得DNA变异、DNA甲基化、mRNA和miRNA表达谱数据,通过数据整构建动态复合基因调控网络,从而识别参与炎癌转化相关的甲基化调控子、转录因子、原因性变异及其信号转导通路等,以前期研究结果为先验知识对网络进行验证,并以这些关键因子对网络进行干预,观察网络的转归,同时以这些关键因子对细胞模型进行干预,观察细胞表型转变;然后,再以临床标本进行检验其临床病理学意义,以期揭示胃炎致胃癌发生发展的分子机制,为胃癌的防治提供新策略和新靶标。

英文摘要

The incurable chronic gastritis is one of the major initiators inducing gastric cancer. Hence, revealing mechanisms of chronic gastritis-inducing gastric cancer provides the experimental basis of identification and application of key factors in clinical control and intervention. The goal of this project is to disclose the molecular mechanisms of gastric cancer develop from chronic gastritis. We will get the clinical samples (normal gastric mucosea, intestinal metaplasia, dysplasia, and gastric cancer) animal models (induced by H.felis) and cell model specimens (retro-differentiate and trans-differentiate) and get high purity cells from these samples by laser capture microdissection. The datasets of DNA mutation, DNA methylation, mRNA and miRNA expression profiles will be developed by DNA sequencing and RNA sequencing. Identify the the methylation of regulator and transcription factors, driver variation and its signal transduction pathways which associated with chronic gastritis transformed into gastric cancer by integrating data analysis and building gene regulatory network. The validation experiments will be performed by perturbation the network in animal models and cell models. The significance will be verified by clinical samples..This project will contribute to the comprehensive understanding in mechanisms of the transformation from chronic gastritis to gastric cancer, and will provide new strategies and therapeutic targets for gastric cancer prevention and treatment.

评估说明

    国家自然科学基金项目“慢性胃炎恶性转化的基因调控网络及其关键节点的研究”发布于爱科学iikx,并永久归类于相关科学基金导航中,仅供广大科研工作者查询、学习、选题参考。国科金是根据国家发展科学技术的方针、政策和规划,以及科学技术发展方向,面向全国资助基础研究和应用研究,发挥着促进我国基础研究源头创新的作用。国科金的真正价值在于它能否为科学进步和社会发展带来积极的影响。

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