课题组前期通过比较抗/感枯萎病甜瓜中抗枯萎病基因FOM-2富含亮氨酸（LRR）区，发现了3个单核苷酸多态性（SNP）位点，本项目旨在此基础上，采用定点突变技术构建分别携带抗病材料3个SNP位点的载体，通过农杆菌介导的转基因方法，将携带抗病SNP位点的Fom-2基因遗传转化感病材料，研究每个SNP位点对枯萎病生理小种0和1的抗性，验证Fom-2基因的SNP位点的功能，进而开发基于功能SNP位点和PCR基础上的抗枯萎病生理小种0和1功能性显性分子标记，为甜瓜抗枯萎病种质筛选与创新及分子标记辅助选择提供理论依据和方法。

甜瓜枯萎病是由尖孢镰刀菌（Fusarium oxysporum f. sp. melonis）引起的的土传病害，是影响甜瓜生长发育的主要因素之一，被称为瓜类作物的“癌症”。本研究以抗/感枯萎病甜瓜为材料，通过扩增和比较Fom-2基因（抗甜瓜枯萎病病原菌生理小种0和1，单基因控制显性抗性）的LRR（亮氨酸）富集区，获得3个单核苷酸多态性位点（SNP），采用限制性内切酶酶切（dCAPS）和等位基因特异性PCR（AS-PCR）方法将SNP位点转化成了基于PCR的分子标记。然后在抗/感枯萎病甜瓜F1与F2代群体中验证SNP位点分离符合单基因控制的显性遗传规律。最后，采用开发的功能性分子标记筛选与鉴定甜瓜抗枯萎病种质资源10份，其中纯和抗性2份，杂合抗性8份。本项目最终建立甜瓜抗枯萎病生理小种0和1的分子育种技术，可大大提高选择的效率和效果，缩短了甜瓜抗枯萎病育种进程。