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发展整合的方法系统地分析流感病毒基因复制的结构基础和分子机理

发展整合的方法系统地分析流感病毒基因复制的结构基础和分子机理
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  • 批准号:31371338
  • 批准年度: 2013年
  • 学科分类:生物信息算法及工具(C060702) |
  • 项目负责人:蒋太交
  • 负责人职称:研究员
  • 依托单位:中国科学院生物物理研究所
  • 资助金额:60万元
  • 项目类别:面上项目
  • 研究期限:2014年01月01日 至 2017年12月31日
  • 中文关键词: 整合;流感;病毒;复制
  • 英文关键词:Influenza virus gene replication and transcription;Influenza virus RNA-dependent RNA polymerase (RdR

项目摘要

中文摘要

流感病毒基因组的转录与复制是流感病毒最重要的生理过程,它是由流感病毒自身编码的三个亚基组成的聚合酶复合物来完成。由于传统研究方法的局限性,我们目前对流感病毒聚合酶三个亚基的相互作用关系是怎样影响流感病毒的复制知之甚少。我们前期的工作已经建立了流感聚合酶亚基共进化的计算机模型和深入开展了流感聚合酶的功能研究。在本项目中,我们将提出整合策略系统地分析流感病毒基因复制的结构基础和分子机理。首先,我们将利用实验系统分析流感聚合酶的之间相互作用,并进一步发展计算模型进行数据整合构建流感聚合酶复合物的三维结构。然后,基于构建的结构,我们将通过定点突变和过表达聚合酶二级结构元件系统地探索三个亚基之间的关系对流感聚合酶功能与流感病毒复制的影响。该项目的实施不仅会使我们深入了解流感病毒的复制机理,还将为设计新型的抗流感药物提供重要靶点。

英文摘要

During influenza virus life cycle, the viral gene replication and transcription is an essential process, which is undertaken by RNA dependent RNA polymerase (RdRp). The influenza RdRp is a heterometric complex composed of three subunits, namely PA, PB1 and PB2. Due to the resistance of the complex to structural determination, we have little knowledge about how the interactions between the three subunits affect influenza viral replication. In our previous work, we have carried out computational coevolution analysis of the three subunits and further performed functional analysis of RdRp activity by experiments. In this proposal, we attempt to systematically analyze the structural basis and molecular mechanism of influenza genome replication by using an integrated approach. We first map the interactions within influenza RdRp, which will be interated with the previous knowledge to construct the overall architecture of influenza RdRp. Then we explore the how the interactions between three subunits affect influenza RdRp function and virus replication by mutational analysis and overexpression of peptides derived from interacting interfaces. This study will not only deepen our understanding of molecular mechanisms underlying influenza virus replication but also shed lights into novel targets for influenza therapeutics.

结题摘要

流感病毒基因组的转录与复制是流感病毒最重要的生理过程,它是由流感病毒自身编码的三个亚基组成的聚合酶复合物来完成。由于传统研究方法的局限性,我们目前对流感病毒聚合酶三个亚基的相互作用关系是怎样影响流感病毒的复制知之甚少。我们已经建立了流感聚合酶亚基共进化的计算机模型和深入开展了流感聚合酶的功能研究。在本项目中,我们提出整合策略系统地分析流感病毒基因复制的结构基础和分子机理。首先,我们利用实验系统分析流感聚合酶的之间相互作用,并进一步发展计算模型进行数据整合构建流感聚合酶复合物的三维结构。然后,基于构建的结构,我们通过定点突变和过表达聚合酶二级结构元件系统地探索三个亚基之间的关系对流感聚合酶功能与流感病毒复制的影响。在此基础上,我们进一步研究了流感病毒聚合酶与宿主因子之间的协调作用,以达到增强流感病毒复制的目的。我们的发现不仅使我们更深入了解流感病毒的复制机理,还为设计新型的抗流感药物提供重要靶点。

评估说明

    国家自然科学基金项目“发展整合的方法系统地分析流感病毒基因复制的结构基础和分子机理”发布于爱科学iikx,并永久归类于相关科学基金导航中,仅供广大科研工作者查询、学习、选题参考。国科金是根据国家发展科学技术的方针、政策和规划,以及科学技术发展方向,面向全国资助基础研究和应用研究,发挥着促进我国基础研究源头创新的作用。国科金的真正价值在于它能否为科学进步和社会发展带来积极的影响。

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