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利用两阶段法全基因组关联研究探寻我国非综合征型先天外中耳畸形的易感基因及功能研究

利用两阶段法全基因组关联研究探寻我国非综合征型先天外中耳畸形的易感基因及功能研究
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  • 批准号:81372085
  • 批准年度: 2013年
  • 学科分类:颅颌面畸形与矫正(H1510) |
  • 项目负责人:章庆国
  • 负责人职称:教授
  • 依托单位:中国医学科学院整形外科医院
  • 资助金额:70万元
  • 项目类别:面上项目
  • 研究期限:2014年01月01日 至 2017年12月31日
  • 中文关键词: 法全基因组关联研究;探寻;综合征型;畸形;易感基因
  • 英文关键词:microtia;causal gene;genome-wide;association study

项目摘要

中文摘要

先天性外中耳畸形是一种常见的耳部发育异常疾患,在我国的发病率为5.18/万人,为第二大颅面部先天缺陷疾病。约90%的患者存在患侧听力障碍,严重影响身心健康。国内外针对非综合征型外中耳畸形的遗传病因学研究较少,至今未找到确信的致病基因。本研究组前期的流行病学研究显示,遗传因素是我国非综合征型外中耳畸形的主因。我们已完成的候选基因关联研究鉴定出若干和外中耳发育相关的基因突变,但它们对该病的贡献不足5%,提示在基因组上仍有许多新的致病基因有待发掘。本课题组拟采用全基因组关联研究的方法,运用两阶段研究策略在全基因组范围内探寻我国非综合征型外中耳畸形的易感位点。采用GoldenGate的方法在大样本中验证候选易感位点,并确定易感基因。检测易感基因内的所有致病突变位点,并在细胞水平研究突变对易感基因编码蛋白功能的影响。本研究将为外中耳畸形的病因学研究,遗传咨询以及可预期的基因治疗提供遗传学支持。

英文摘要

Microtia can be defined as a malformation of the external and middle ear with varying severity ranging from minimal structural abnormalities to total absence of the earlobe that results can range from mild distortion of the anatomic landmarks to the complete absence of the ear. The prevalence rate of microtia in China is about 5.18 per 10000 newborns. Greater than 90% of individuals with microtia experience conductive hearing disorder on the affected side, which have great influence to patients' life quality. Previous studies on nonsyndromic microtia were mainly focused on plastic surgery and environment causes. Thus far, no confident genetic risk factors were reported. Our epidemiology study showed that the disease is greatly affected by genetic risks in Chinese populations. Our published results from a candidate gene association study showed that some variants associated with nonsyndromic microtia, but they explained less than 5% of the trait variance,which indicate that further study is needed to give deeper insight on the etiology of microtia. Therefore, the next step is to find other susceptibility genes of nonsyndromic microtia at genome-wide level with an association study. The aim of our study is to explore the potential relationship between genetic factors and congenital microtia. Two-staged genome-wide association study will be employed to identify the new susceptibility genes of nonsyndromic microtia in Chinese people.we will detect more causal variants in susceptibility genes and conduct functional experiments to determine their effects on coding protein. Our results will not only improve the etiology knowledge of microtia, but also be helpful for genetic consultation and future gene therapy.

结题摘要

先天性外中耳畸形是一种常见的耳部发育异常疾患,在我国的发病率为5.18/万人,为第二大颅面部先天缺陷疾病。约90%的患者存在患侧听力障碍。本研究组前期的流行病学研究显示,遗传因素是我国非综合征型外中耳畸形的主因。本课题组采用全基因组关联研究的方法,针对942份病例和2012份对照病例进行基因分型。运用两阶段研究策略在全基因组范围内探寻我国非综合征型外中耳畸形的易感位点。采用Sequenom的方法在大样本中验证13个易感基因。该研究成果发表于《Nature communications》。本研究将为外中耳畸形的病因学研究,遗传咨询以及可预期的基因治疗提供遗传学支持。

评估说明

    国家自然科学基金项目“利用两阶段法全基因组关联研究探寻我国非综合征型先天外中耳畸形的易感基因及功能研究”发布于爱科学iikx,并永久归类于相关科学基金导航中,仅供广大科研工作者查询、学习、选题参考。国科金是根据国家发展科学技术的方针、政策和规划,以及科学技术发展方向,面向全国资助基础研究和应用研究,发挥着促进我国基础研究源头创新的作用。国科金的真正价值在于它能否为科学进步和社会发展带来积极的影响。

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