石虎为芸香科植物石虎的干燥近成熟果实，是药材吴茱萸的重要来源品种，为湖南道地药材。但其有效成分产生的机制、道地性形成的原因尚不清楚，严重的制约了吴茱萸相关产品的开发。本项目以吴茱萸主要品种石虎为出发点，利用AFLP，ITS，DGGE等分子标记技术和TLC，HPLC，GC-MS，LC-MS等分析检测技术以及SPSS统计分析等方法，进行土壤微生物、内生菌以及石虎道地性的研究，探索道地性与生境微生物的关系问题，研究"环境微生物- - 内生菌- - 道地药材"的相互关系，揭示"中药道地药材"的成因机制，为中药材种植生产的产地选择关键技术提供思路，可望利用吴茱萸内生菌生产次生代谢产物，促进中药资源的可持续发展。

项目从土壤微生物，内生菌角度讨论吴茱萸药材石虎品种的道地性成因。选择道地产区贵州铜仁，湖南新晃，以及非道地产区湖南浏阳等地的栽培石虎品种作为研究材料，对这些地区的土壤酶活力，土壤微生物群落进行分析；并分离植物组织材料的内生真菌和内生细菌；同时，以AFLP，SRAP，RAPD、ITS分子生物学方法研究石虎品种的遗传多样性，以吴茱萸碱、吴茱萸次碱和吴茱萸内酯作为吴茱萸品质的评价手段，考察土壤微生物，内生菌对道地性的影响，并分析遗传在石虎药材品质中的作用。研究表明石虎遗传背景基本稳定，但各居群存在较小差异；道地性产区的石虎内生菌多样性较大，有特殊的致病性内生真菌；且土壤酶活力较强，各生理类群的微生物比较特殊。微生物，土壤环境及内生菌对石虎道地性的形成有一定影响。