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链霉菌的分子分类体系及多位点序列分型研究

链霉菌的分子分类体系及多位点序列分型研究
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  • 批准号:30670002
  • 批准年度: 2006年
  • 学科分类:细菌、放线菌及古菌多样性、分类及系统发育(C010101) |
  • 项目负责人:黄英
  • 负责人职称:研究员
  • 依托单位:中国科学院微生物研究所
  • 资助金额:25万元
  • 项目类别:面上项目
  • 研究期限:2007年01月01日 至 2009年12月31日
  • 中文关键词: 链霉菌;分类;多位点序列分型
  • 英文关键词:streptomyces;;database;;groups

项目摘要

中文摘要

链霉菌是产生天然生物活性物质的主要微生物资源,具有高度的物种多样性和代谢多样性。但是,大量的"种"和传统分类无统一标准造成了链霉菌分类体系的混乱和准确鉴定的困难,也制约了链霉菌资源的开发。本项目在已有的研究基础上,根据rep-PCR(BOX)数据库、16S-ITS RFLP数据库和16S rRNA基因序列数据库信息聚类分析所得的树状谱,通过比较分析,引入MLST技术,对链霉菌属的分类体系进行科学划分,重新确立各代表类群,提出各类群的分子指征,构建更合理、更接近自然的链霉菌新分类体系。同时建立链霉菌MLST分类的新方法,和部分菌株的MLST数据库,为构建国际通用、高分辨率的链霉菌分子鉴定新平台打下基础;并探索MLST方法提示菌株生物活性的潜力以及在放线菌分类中的应用前景。为链霉菌的快速、准确鉴定提供有效途径和可靠蓝图,也为链霉菌资源的开发、利用以及链霉菌生态学的研究提供科学指导和依据。

结题摘要

链霉菌是产生天然生物活性物质的主要微生物资源,具有高度的物种多样性和代谢多样性。但是,大量的"种"和传统分类无统一标准造成了链霉菌分类体系的混乱和准确鉴定的困难,也制约了链霉菌资源的开发。本项目在已有的研究基础上,根据rep-PCR(BOX)数据库、16S-ITS RFLP 数据库和16S rRNA 基因序列数据库信息聚类分析所得的树状谱,通过比较分析,引入MLST 技术,对链霉菌属的分类体系进行科学划分,重新确立各代表类群,提出各类群的分子指征,构建更合理、更接近自然的链霉菌新分类体系。同时建立链霉菌MLST 分类的新方法,和部分菌株的MLST 数据库,为构建国际通用、高分辨率的链霉菌分子鉴定新平台打下基础;并探索MLST 方法提示菌株生物活性多样性的潜力以及在放线菌系统学中的应用前景。为链霉菌的快速、准确鉴定提供有效途径,也为链霉菌资源的开发利用以及链霉菌生态学的研究提供科学指导和依据。

评估说明

    国家自然科学基金项目“链霉菌的分子分类体系及多位点序列分型研究”发布于爱科学iikx,并永久归类于相关科学基金导航中,仅供广大科研工作者查询、学习、选题参考。国科金是根据国家发展科学技术的方针、政策和规划,以及科学技术发展方向,面向全国资助基础研究和应用研究,发挥着促进我国基础研究源头创新的作用。国科金的真正价值在于它能否为科学进步和社会发展带来积极的影响。

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