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水稻抗白叶枯病基因Xa-25(t)的图位克隆

水稻抗白叶枯病基因Xa-25(t)的图位克隆
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  • 批准号:30471066
  • 批准年度: 2004年
  • 学科分类:稻类作物遗传育种学(C130501) |
  • 项目负责人:高东迎
  • 负责人职称:副研究员
  • 依托单位:江苏省农业科学院
  • 资助金额:19万元
  • 项目类别:面上项目
  • 研究期限:2005年01月01日 至 2007年12月31日
  • 中文关键词: 水稻;白叶枯病;Xa-25(t);图位克隆
  • 英文关键词:;;map-based cloning

项目摘要

中文摘要

Xa-25(t)是我们从水稻体细胞突变体HX-3中鉴定出的一个广谱抗白叶枯病新基因,该基因已被定位到第4染色体长臂末端。本研究利用02428和HX-3构建的F2大群体,对Xa-25(t)进行精细定位研究,并根据国际水稻基因组测序数据,开展候选基因的功能预测和界定,设计相关引物对HX-3基因组DNA进行高保真PCR扩增,获得Xa-25(t)侯选基因全长gDNA片段,并克隆测序。设计引物对HX-3的cDNA进行扩增,获得侯选Xa-25(t)全长cDNA片段,并转化感病水稻,进行功能互补试验。为水稻抗白叶枯病分子育种提供新的基因,并为研究抗白叶枯病的分子机制和阐述组织培养诱发水稻抗病性变异机理提供有用信息。

结题摘要

Xa25是我们从细胞突变体HX-3中鉴定出的一个广谱抗白叶枯病新基因,并已被定位到第4染色体长臂末端。本项目研究主要是利用图位克隆的方法分离Xa25,为水稻抗病分子育种提供目的基因。利用HX-3和两个感病材料02428和金刚30,我们构建了两个F2大群体,并对以前得到的02428/HX-3的DH群体的抗性进行了修正,同时利用最近发布的水稻SSR标记,对02428/HX-3的双单倍体(DH)群体进行分析,将Xa25定位到RM17571和RM5506之间,再根据水稻基因组测序结果,开发设计新的Indel标记,进一步将Xa25定位到Indel 40和RM17578之间的约40kb的区间内,预测有3个候选基因,分别是一个功能未知的表达蛋白、乙烯响应因子和质膜ATP酶,其中乙烯响应因子与植物抗逆有关,被认为是Xa25的候选基因。设计引物扩增HX-3的(突变体)和感病供体材料明恢63(野生型)的基因组DNA,得到全长候选基因片段,并克隆测序,发现二者有4个碱基的替换,这可能与HX-3的抗病有关。目前正在做转基因互补实验,以确定Xa25的候选基因。本项目研究发表论文6篇,申请国家发明专利1项。

评估说明

    国家自然科学基金项目“水稻抗白叶枯病基因Xa-25(t)的图位克隆”发布于爱科学iikx,并永久归类于相关科学基金导航中,仅供广大科研工作者查询、学习、选题参考。国科金是根据国家发展科学技术的方针、政策和规划,以及科学技术发展方向,面向全国资助基础研究和应用研究,发挥着促进我国基础研究源头创新的作用。国科金的真正价值在于它能否为科学进步和社会发展带来积极的影响。

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