以一组水稻单片段代换系为材料，将控制水稻F1花粉不育性的复杂遗传基础分解为单个遗传因子，在相对一致的遗传背景下，对F1花粉不育基因座位S-c、S-d和S-e不同来源的等位基因的遗传效应进行比较分析，了解这三个基因遗传分化的特点；然后通过构建并检测单片段杂合代换系、双片段杂合代换系和三片段杂合代换系的花粉育性表型，探明这三个F1花粉不育基因之间的遗传互作方式；本研究还将分析遗传背景对F1花粉不育基因遗传效应的影响。本项目预期研究结果将进一步揭示水稻亚种间杂种花粉不育性的遗传本质，充实和完善"特异亲和性"假说的学术思想，进而促进水稻杂种不育和杂种优势利用理论的发展；同时本项研究对于粳型亲籼系的选育和利用具有重要的指导意义。此外，本项目所采用的研究思路和方法对于水稻其它遗传基础复杂的性状进行相关研究也有一定的参考价值。

以一组水稻单片段代换系、近等基因系和粳型亲籼系为被测材料，通过调查各被测系与受体亲本或测验种的测交F1和单片段代换系间互交F1的花粉育性，对F1花粉不育基因座位S-c、S-d和S-e不同来源的等位基因遗传效应进行了比较分析，结果表明：对每一个座位，不同材料中不但存在Si、Sn及Sj三种不同的等位基因，而且不同来源的Si或Sj之间遗传效应不同，即存在分化程度的差异。用单片段代换系构建出单片段杂合代换系、双片段杂合代换系和三片段杂合代换系，比较这三类材料花粉育性表型，研究了三个F1花粉不育基因之间的遗传互作方式，结果表明；各个F1花粉不育基因座位的作用是相互独立的，不存在明显的遗传互作。本项目研究结果进一步揭示了水稻亚种间杂种花粉不育性的遗传本质，充实和完善了"特异亲和性"假说的学术思想，有助于水稻杂种不育和杂种优势利用理论的发展；同时本项研究对于粳型亲籼系等材料的选育和利用具有重要的指导意义。此外，本项目所采用的研究思路和方法对于水稻其它遗传基础复杂的性状进行相关研究也有一定的参考作用。