银鱼科鱼类为一年生小型鱼类，主要分布于我国及日本等周边国家，具有鱼类罕见的幼态持续和发育偏差现象,且生境高度异质化。我们通过近两年对世界范围内6属15种30多个银鱼种群的分子系统学研究认为太湖新银鱼N.taihuensis,近太湖新银鱼N.pseudotaihuensis, 和陈氏新银鱼N.tangkahkeii应为同种异名。目前,银鱼自然资源已在世界范围内急剧下降，自1979年被人为大规模移植的太湖新银鱼种质资源管理严重混乱，资源量在经过短期爆发后持续低迷。因此本项目拟利用线粒体DNA细胞色素b全序列分析，通过对分布于不同水域的上述新银鱼种群遗传结构的分析，揭示新银鱼属鱼类自然种群和移植种群的遗传多样性及其生存状态，为银鱼资源的保护提供可信的信息。同时根据分子系统地理学分析方法对以上自然种群分布格局的形成和进化过程进行深入探讨，以期为进化显著单元或管理单元的确定提供科学依据。

本研究通过对分布于不同水域的陈氏新银鱼Neosalanx tangkahkeii 13 个自然种群 354 个体细胞色素 B基因全序列分析显示：1）本种具有较高的单倍型多样性（0.713±0.022），而核苷酸多样性较低（0.0022±0.0001）；2）基于系统和Network分析的结果，该种遗传结构没有明显的地理格局，遗传分化与地理距离没有直接相关（P = 0.59）；分子变异分析（AMOVA）表明，长江流域、淮河流域和珠江流域之间没有显著的遗传分化(ФCT=0.0843, P = 0.1686)， 但 各自然种群内和种群间均有显著的遗传分化(ФST=0.4970, ФSC=0.4506, P<0.001)。长距离独立的建群事件、 限制基因流以及种群的持续扩张共同形成了太湖新银鱼目前的遗传格局；3） 中性检验、歧点分布和基于溯祖理论的最大似然法进一步分析表明，珠江流域种群为长期稳定种群，而长江淮河流域种群均为近期扩张种群。通过对长淮流域种群的检测，绝大部分变异发生在 16.2 kyr 以后，与最后一次冰期全面消退海平面上升，长江及淮河流域中下游大量湖泊（适宜生境）形成的时间相吻合。