在前期工作中通过蛋白芯片飞行时间质谱先后发现了20余个对卵巢癌具有潜在诊断意义（均为p<0.01）的蛋白峰，但由于目前方法鉴定蛋白成功率低，仅成功鉴定了少数几个蛋白，因此，拟在此基础上，以卵巢癌中占50%的浆液性上皮癌的血浆为研究对象，以卵巢交界性、良性浆液性瘤和非卵巢肿瘤病人血浆为对照，利用自由流等电聚焦（FFE-IFE）技术对蛋白组分按等电点加以分离，通过SDS-PAGE电泳和凝胶染色图谱分析，确认卵巢癌特异性蛋白条带，对含量低的特异蛋白可通过多次FFE或加大上样量以及冻干浓缩到达富集的效果，经统计学方法建立诊断模型，对确认的差异蛋白（含量变化超过2倍）进行二级质谱鉴定，明确为何种蛋白，为通过免疫检测验证所获蛋白的诊断价值，用于卵巢癌早期诊断/筛查、手术及化疗效果评价及预测复发奠定基础，也为从蛋白质到基因的逆行途径研究卵巢癌发生机制提供新的线索。

目前提高卵巢癌病人生存率的关键在于早期诊断，卵巢癌的发生有可能带来血浆蛋白质组学上的变化。血浆蛋白成分复杂，自由流电泳采用液相介质，通过等电聚焦能简化蛋白成分。我们研究卵巢癌蛋白质组学，希望能发现卵巢癌早期诊断的血浆标志物。方法：收集32例浆液性卵巢癌病人血浆，其中早期组包括I，II期7例，晚期组包括III,IV期25例，收集10例卵巢囊肿病人血浆作为对照组，将对照组，早期组，晚期组血浆分别等体积混合后，使用自由流电泳分离，iTRAQ定量蛋白质组学方法分析。结果：鉴定出蛋白为载脂蛋白A-II前原蛋白，白蛋白前原蛋白，载脂蛋白F前原蛋白，血管紧张肽原，载脂蛋白A-I前原蛋白，血清淀粉状蛋白前原蛋白，alpha-2-HS糖蛋白，丝氨酸蛋白酶抑制物，血清类粘蛋白1前原蛋白，运甲状腺素蛋白，补体4A前原蛋白, 其中肿瘤组载脂蛋白A-II前原蛋白含量显著增高，白蛋白前原蛋白显著降低。结论：我们筛选出载脂蛋白A-II前原蛋白为卵巢癌可能的标志物，但其意义还需进一步探讨。