本研究建立了简单、经济的蛋白质复合物分离方法，避免了分离过程中的蛋白质损失及蛋白质的体外化学修饰，减少了复合物分离过程所需的蛋白质洗脱设备，对四株具有不同分化能力的胰腺癌细胞系（SW1990,PANC-1,BxPC-3, CFPAC-3）的蛋白酶体复合物的进行了分离。应用质谱技术研究了每个蛋白酶体的亚基组成、亚型，翻译后修饰及其相互作用。发现了四株具有不同分化能力的胰腺癌细胞系的蛋白酶体的亚基组成成分存在明显的差异，该发现为不同分型的胰腺癌提供重要的个体化治疗和诊断信息。.建立了简单、廉价的生物大分子复合物质谱分析方法，为研究蛋白质复合物结构及其内部亚基相互作用提供了新的技术平台，为开展结构生物学研究提供了新的技术手段。

In this study, simple, economical separation approach for studying protein assembly was established which avoid the loss and in vitro modification of proteins during the separation processes. Proteasomes from four pancreatic cancer cells (SW1990, PANC-1, BxPC-3, and CFPAC-3) were successfully separated using the above approach, respectively. Their subunit components, subtypes, modification and interaction among subunits were investigated by mass spectrometry. The subunit differentiations among four proteasome were detected, which may provide important clues to personalized treatment and diagnosis of pancreatic cancer..In this study, mass spectrometry-based analytical platform for studying protein assembly and protein-protein interactions was also established, which is novel tool to probe the structure of protein assembly.

本研究建立了简单、经济的蛋白质复合物分离方法，避免了分离过程中的蛋白质损失及蛋白质的体外化学修饰，减少了复合物分离过程所需的蛋白质洗脱设备，对四株具有不同分化能力的胰腺癌细胞系（SW1990,PANC-1,BxPC-3, CFPAC-3）的蛋白酶体复合物的进行了分离。应用质谱技术研究了每个蛋白酶体的亚基组成、亚型，翻译后修饰及其相互作用。发现了四株具有不同分化能力的胰腺癌细胞系的蛋白酶体的亚基组成成分存在明显的差异，该发现为不同分型的胰腺癌提供重要的个体化治疗和诊断信息。建立了简单、廉价的生物大分子复合物质谱分析方法，为研究蛋白质复合物结构及其内部亚基相互作用提供了新的技术平台，为开展结构生物学研究提供了新的技术手段。