本课题组前期利用收集到的一万余份寻常型银屑病样本完成了中国第一个全基因组关联分析（genome-wide association analysis, GWAS）研究，发现LCE基因家族与银屑病密切相关，并建立了5000多人份覆盖全基因组62万个SNP分型数据的数据库。基于此，我们拟探索一种新的以基因为研究单位的关联分析方法对银屑病全基因组的分型数据进一步分析，以期发现汉族人寻常型银屑病新的易感基因，以及进行易感基因之间的交互作用研究，为阐明银屑病的发病机制、风险预测和诊断治疗提供依据。同时将新的关联分析方法编制软件推广，改变目前易感基因研究结果不易得到重复的现状，推动全基因组关联分析进入大规模数据深入分析阶段。

本课题组在前期两次银屑病GWAS研究的基础（Nature Genetic 2010; Nature Genetic 2011）上，综合Bootstrap 和Random Forest两种新型统计学分析方法，以基因为基础，对5000余份全基因组关联分析数据进行分析，发现了多个汉族人疾病易感基因。后续研究又选取近3000份（1,139病例 VS 1,132对照）GWAS数据（Illumina Human 610-Quad芯片），挑选其中包含MHC区域的 3,132个SNPs，运用Bootstrap和Random Forest统计方法进行分析，采用Logistic回归似然比检验评估两点SNP的交互作用，建立两点SNP的主作用模型和全模型（包括主作用过程和相互作用过程），发现HLA-C和HLA-DQA2在银屑病发病中起重要作用。与本课题组白癜风GWAS分型数据比较，发现银屑病和白癜风在MHC区域具有共同的易感基因。此外，运用多种统计学分析方法，充分发掘已有的银屑病GWAS分型数据，发现MHC区域的遗传变异与汉族人银屑病多种临床亚型的相关性；发现汉族人银屑病易感基因LCE、MHC和IL12B之间存在基因交互作用；超重和肥胖在银屑病群体中发生概率明显增加，银屑病的发病程度与体重指数（BMI）呈正相关，超重和肥胖因素可作为银屑病临床评价的指标之一；运用Meta 分析，评价了NOD2/CARD15多态性与银屑病和关节型银屑病的关系；证实吸烟与银屑病发病风险具有很强的相关性，可运用于临床预防和发病风险评估；采取MDR（多因素降维分析法）和Logistic Regression的方法，发现IL23/Th17信号通路多个基因交互作用在银屑病发病过程中存在作用，这些银屑病系列深入研究不仅能推动全基因组关联分析进入大规模数据深入分析阶段，也为进一步阐明银屑病的发病机制、风险预测和诊断治疗提供重要的科学依据。