中文摘要
以家蚕(Bombyx mori)丝腺这一真核生物中最为高效的蛋白质合成组织 之一作为研究对象,在转录组和蛋白质组水平上同时对其中特异性表达的基因及其蛋白质产物进行系统研究。转录组学的研究将采用双链特异性核酸酶归一化和直接RT-PCR等方法克隆50-100个低丰度的全长cDNA序列。蛋白质组水平的研究将从两个方向同时进行:1) 利用多种分离手段大量制备丝腺细胞及丝腺腔中的天然蛋白,并利用蛋白质组学的手段鉴定之;2) 高效表达一些重要基因的全长cDNA克隆,并制备这些重组蛋白的多克隆抗体,以用于丝腺细胞中这些蛋白质的表达检测,并基于免疫共沉淀或亲和层析等手段微量制备和分析上述蛋白质及其在细胞内形成蛋白质复合物,从而构建这些主要蛋白质的相互作用网络。另外,我们将力争利用X射线晶体学的方法解析2-3个关键蛋白质的三维结构。综合各个层面上的研究以初步阐明丝心蛋白特异性高效表达的分子基础。
英文摘要
Using the silkgland of Bombyx mori, one of the most efficient protein synthesis tissues as a model system, we will investigate, in parallel, the specifically expressed genes and their protein products at the transcriptomic and proteomic levels. The work of transcriptomics will be cloning of 50 to 100 low abundancy cDNAs of the full length, by means of nuclease normalization and RT-PCR. The research at the proteomic level will be focused on two parts. One is preparation and identification of native proteins in the silkgland. Another is to overexpress of a series of full length cDNAs, and to prepare the multiclonal antibodies of these recombinant proteins which will be used for purification of the proteins of low abundancy with the technique of co-immunoprecipitation or affinity chromatography. Moreover, we will try to solve the crystal structures of 2 to 3 important proteins. Together, the data will enable us to construct a preliminary protein interaction network in the silkgland, and shed lights to the molecular basis for the highly specific overexpression of the fibroin.
结题摘要
以家蚕(Bombyx mori)丝腺这一真核生物中最为高效的蛋白质合成组织 之一作为研究对象,在转录组和蛋白质组水平上同时对其中特异性表达的基因及其蛋白质产物进行系统研究。转录组学的研究将采用双链特异性核酸酶归一化和直接RT-PCR等方法克隆50-100个低丰度的全长cDNA序列。蛋白质组水平的研究将从两个方向同时进行:1) 利用多种分离手段大量制备丝腺细胞及丝腺腔中的天然蛋白,并利用蛋白质组学的手段鉴定之;2) 高效表达一些重要基因的全长cDNA克隆,并制备这些重组蛋白的多克隆抗体,以用于丝腺细胞中这些蛋白质的表达检测,并基于免疫共沉淀或亲和层析等手段微量制备和分析上述蛋白质及其在细胞内形成蛋白质复合物,从而构建这些主要蛋白质的相互作用网络。另外,我们将力争利用X射线晶体学的方法解析2-3个关键蛋白质的三维结构。综合各个层面上的研究以初步阐明丝心蛋白特异性高效表达的分子基础。
