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染色体19q13.3围绕DNA修复基因亚区域的肺癌基因组关联研究

染色体19q13.3围绕DNA修复基因亚区域的肺癌基因组关联研究
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  • 批准号:81072384
  • 批准年度: 2010年
  • 学科分类:非传染病流行病学(H2610) |
  • 项目负责人:尹娇杨
  • 负责人职称:教授
  • 依托单位:沈阳医学院
  • 资助金额:30万元
  • 项目类别:面上项目
  • 研究期限:2011年01月01日 至 2013年12月31日
  • 中文关键词: 染色体;19q13.3;DNA;肺癌;关联
  • 英文关键词:Chr19q13.3;ERCC2, PPP1R13L, CD3EAP and ER;Fine-mapping;Lung cancer;Chinese (Asians/Yellow race)

项目摘要

中文摘要

采用HapMap tag SNPs间接策略及目前国际多采用的两阶段研究设计:进行中国东北地区汉族群体肺癌病例-对照区域性基因组关联分析:聚焦在染色体19q13.3亚区域ERCC1到ERCC2 70kb范围的4个基因:ERCC1、ASE-1、RAI及ERCC2, 全面考虑其完整基因的常见变异及特异组合的常见单体型(域)/双体型,及其与吸烟等环境因素相互作用与肺癌的关联,重点在于构建染色体19q13.3亚区域肺癌易感性连锁不平衡精细图谱(未见报道)及关联验证,进一步精细定位:与肺癌发生强烈相关联的主要易感性基因的DNA序列范围及效应器,并将中国汉族群体与丹麦高加索群体相对比:是否具有同样的与肺癌(癌症)发生紧密相关的古老单体型(域)或"年轻"的、具有群体特异性的单体型(域)。为进一步的功能研究、临床化疗药物抵抗的相关性研究及中国人肺癌的发生、预防、诊断、治疗策略提供理论基础和科学依据。

结题摘要

为精细定位中国人(亚洲人/黄种人)染色体19q13.3相关四个基因(ERCC2, PPP1R13L, CD3EAP and ERCC1)亚区域潜在的肺癌病因及关联序列,项目(批准号:81072384)执行了中国群体肺癌病例-对照chr19q13.3涉及此四个相关基因亚区域的基因组关联分析。采用 HapMap tag SNPs 间接策略, 逐一分析各个基因及总体基因联合分析,初步定位可能的风险序列范围,进一步采用精细制图策略,执行了此染色体亚区域横跨71.654kb范围的精细图谱研究,对于单一位点五种遗传模型分析提示:7个紧密相邻的SNPs(PPP1R13L rs1970764, rs1005165, CD3EAP rs967591, rs735482, rs1007616, rs62109563, and ERCC1 rs3212965)显示了与肺癌发生风险有意义的相关联;基因-基因-环境相互作用MDR模型分析提示:吸烟持续性和ERCC2、PPP1R13及ERCC1 htSNPs遗传变异高序相互作用的效应是肺癌发生风险的强烈预报器;首次对中国群体(亚洲人/黄种人)此亚区特异性高风险双体型复制研究提示:高加索群体验证报道的癌症相关高风险双体型的部分组成成份:PPP1R13L rs1970764 和CD3EAP rs967591的变异等位基因可能是中国群体(亚洲人/黄种人)中肺癌发生的风险因素,但因其高风险双体型在中国群体(亚洲人/黄种人)的罕见,不可能是该人种的肺癌风险因素;中国群体(亚洲人/黄种人)chr19q13.3相关四个基因亚区域的精细图谱研究提示:增强肺癌易感性效应器的中心区域定位于:围绕从PPP1R13L intron8 rs1970764到CD3EAP 3' near gene rs62109563的23.173kb范围。项目首次在国际上系统研究及定位绘制完成了中国人(亚洲人/黄种人)染色体19q13.3相关四个基因亚区域的肺癌(癌症)易感性连锁不平衡/精细图谱。目前,本项目研究成果已发表Carcinogenesis,Mutat Res,Environ Mol Mutagen,Lung Cancer等国际SCI期刊论文7篇(累积SCI影响因子约:22.611)。

评估说明

    国家自然科学基金项目“染色体19q13.3围绕DNA修复基因亚区域的肺癌基因组关联研究”发布于爱科学iikx,并永久归类于相关科学基金导航中,仅供广大科研工作者查询、学习、选题参考。国科金是根据国家发展科学技术的方针、政策和规划,以及科学技术发展方向,面向全国资助基础研究和应用研究,发挥着促进我国基础研究源头创新的作用。国科金的真正价值在于它能否为科学进步和社会发展带来积极的影响。

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