执行前期基金项目发现，同卵双生子具患病一致性而非同步性特点，为探求双生子间差异本质，基于结构与功能相关性设计，以全基因组表达谱芯片和单核甘酸多态（SNP）芯片为核心技术，考察基因表达（功能）与SNP分布（结构），发现对内证候差异越大，差异表达基因越多，而对内SNP没有显著的差异，对基因表达不构成影响。在寻找答案过程中认识到，表型证候不一致的同卵双生子是研究疾病表观遗传机制最合适对象，通过基因修饰状态探寻其表达状态，有可能揭示同卵双生子证候差异机制。本计划拟以前期正常-患病双生子为对象，从4各层次（1.整体证候2.甲基化相关酶3.全基因组甲基化水平4.甲基化特异位点广泛性），以全基因组CpG岛芯片和MS-HRM为关键技术、生物信息融合为最终手段，探讨正常-脑瘫肾虚双生子证候差异，并与前期表达谱结果比对，获取脑瘫肾虚证全基因组甲基化特征谱式，筛选脑瘫表观标志分子，为脑瘫的早期诊断打下基础。

在前期基金研究的基础上，本课题对正常-病证双生子全基因组DNA进行了甲基化芯片检测，并对其印记基因表达是否存在差异进行了筛选，获得了一系列有意义的结果：①正常-病证双生对间证候差异越大，差异表达基因越多，但由甲基化调控引发的差异表达占12%左右；②通过对甲基化调控基因的生物信息分析，获取了与病证密切相关的甲基化调控基因群；③同时课题组认为其它如来自组蛋白修饰等的表观调控，值得今后进一步研究；④利用数据库比对，发现双生对间印记基因存在差异表达，其差异印记基因的多少随双生对年龄、病证复杂程度增加，候选了与脑瘫、糖尿病等复杂病症特征密切相关的印记基因组。 基金资助下，调查分析了来自宜宾市、彭州市和什邡市三地收集到的新生儿31423例，获取了478对双生子，其中宜宾、彭州、什邡三地双生子出生率分别为1.78%、1.35%、1.29%，在我国双生子出生率1-2%之间的范围，基本掌握了四川双生子的出生情况，增加了双生子研究资料与对象，为课题持续进行奠定了基础。 基金资助下，培养四川省学科带头人后备人选1人，青年骨干教师2名，硕士2名（毕业1名，在读1名），课题组成员参加学术及培训会议 3 人次；发表学术论文 4篇，核心 2篇，基本完成预期计划。