应用FIASCO(Fast isolation by AFLP of sequences containing repeats)技术从长江江豚基因组中分离出一批微卫星位点，并设计相应PCR扩增引物，用现有江豚样品对引物的有效性进行评估，最终筛选出一批适合于该物种的特异性微卫星引物；随后以这些微卫星标记作为工具解决与长江江豚的保护紧密相关的一些保护遗传学核心问题，例如种群遗传多样性水平、遗传结构及种

长江江豚是我国长江中分布的一种独特的江豚淡水亚种，目前其种群状况极度濒危，亟待加强保护。为了深入开展该种群的保护遗传学研究，本课题应用FIASCO(Fast isolation by AFLP of sequences containing repeats)技术从长江江豚基因组中分离出70余个微卫星位点，并最终筛选得到25个物种特异性和多态性微卫星标记。随后，课题组将其中的一些多态性微卫星标记应用于长江江豚的遗传多样性水平评估、亲子鉴定等保护遗传学研究。已有研究结果表明，长江江豚自然种群及石首天鹅洲保护区迁地保护繁殖群体均具有中等水平的核DNA遗传多样性，它们的期望杂合度和观察杂合度分别为0.510和0.666，及0.516和0.694。此外，课题组也成功地应用微卫星标记对3个迁地保护或人工饲养繁殖群体中出生的个体进行了亲子关系鉴定，并根据研究结果对长江江豚的遗传管理提出了一些建议。该课题的顺利实施不仅加强了长江江豚的保护遗传学研究，本研究所获得的微卫星标记也极大地丰富了鲸类的遗传标记资源，对中华白海豚等其它濒危鲸类物种的保护遗传学研究也具有重要参考意义。