随着生物学和生物产业的发展，基因相关的专利数据也越来越多的被重视和使用。据欧洲专利局发布的数据，目前有逾448万条的DNA序列被进行了专利保护。如何合理有效的将专利数据与现如今的基因组数据进行关联是一个需要解决的现实问题，而目前国际上也缺少这一交叉领域的研究。本项目旨在利用专利DNA的信息对于微生物基因组进行注释，充实已有的微生物基因组学知识，并为微生物产业开发提供重要的信息资源。项目预期开发基因专利信息相关的微生物基因组注释平台，能够将已有的专利DNA的信息注释到现有微生物基因组，并将提供高效的查询方式和友好的用户界面以便用户使用。整个平台将采用基于网络的三次结构设计：包括数据库层、应用程序层和用户界面层。该系统的开发将会为基于专利知识的微生物基因组分析提供有效的工具，并将为生物产业的发展指明潜在的方向。

随着生物学和生物产业的发展，基因相关的专利数据也越来越多的被重视和使用。据欧洲专利局发布的数据，目前有逾58万条与微生物相关的DNA序列被进行了专利保护。如何合理有效的将专利数据与现如今的基因组数据进行关联是一个需要解决的现实问题，而目前国际上也缺少这一交叉领域的研究。本项目整合了微生物基因组信息、基因专利信息，利用数据库层-应用层-数据展示层三层结构建立了基于专利信息的微生物基因组注释系统（http://genome.im.ac.cn），将海量的微生物基因、基因组数据与相关专利信息相互联系，通过基因组的检索能够最终连接到专利的摘要信息。目前，该系统已经应用于基于专利信息的数据挖掘和微生物基因组注释相关的工作。与此同时，本项目的技术平台还用于了诸如生命条形码信息系统、禽流感信息系统的开发和应用。在整个项目执行过程中，建设数据平台4个；参与发表SCI论文8篇；参与编写著作章节1篇；进行国际会议报告5次；培养硕士研究生3名；出站博士后1名。