沼气技术是解决我国农村能源危机和环境污染，实现农业可持续发展的有效途径。由于传统研究手段的限制，目前对沼气发酵生态系统缺乏全面、准确的了解，从而阻碍了工艺和工程的改进进程，致使农村系统运行效率低和可控性差的问题难以解决。现代分子生态学技术在环境微生物研究中的成功应用，为突破这一技术瓶颈提供了新思路。本项目拟综合运用DGGE指纹图谱分析、克隆文库分析、荧光原位杂交（FISH）和实时荧光定量PCR等分子生态学技术，对沼气发酵系统微生物的群落结构和种群多样性、及其动态变化进行跟踪监测；结合发酵运行效能的测定，揭示群落结构与功能的关系，明确沼气发酵的优势功能种群；结合传统的微生物研究方法，选育低温沼气发酵重要功能菌。从而为优化群落结构、调节群落功能提供可靠科学依据，为实现我国农村沼气发酵的高效、可控运行奠定基础。

沼气技术是解决我国农村能源危机和环境污染，实现农业可持续发展的有效途径。由于传统研究手段的限制，目前对沼气发酵生态系统缺乏全面、准确地了解，从而阻碍了工艺和工程的改进进程，致使农村沼气系统"越冬难"、运行效率低等问题难以解决。本项目运用基于16s rDNA的DGGE指纹图谱分析和克隆文库分析等分子生态学技术，对农村户用沼气发酵系统微生物的群落结构进行了分析，初步揭示了沼气发酵的优势功能种群。为低温沼气发酵重要功能菌的选育及应用，解决农村沼气"越冬难"问题，实现沼气发酵的高效运行奠定了基础。