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蛋白质分离鉴定平台中酶反应器及相关接口的集成化研究

蛋白质分离鉴定平台中酶反应器及相关接口的集成化研究
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  • 批准号:20605023
  • 批准年度: 2006年
  • 学科分类:骨、关节、软组织损伤与修复(H0605) |
  • 项目负责人:李子荣
  • 负责人职称:暂无数据
  • 依托单位:中国科学院大连化学物理研究所
  • 资助金额:0万元
  • 项目类别:面上项目
  • 研究期限:2007年01月01日 至 2009年12月31日
  • 中文关键词: 蛋白质分离;平台;酶反应器;接口;集成化
  • 英文关键词:Proteomics; polymer monolithic; membrane interface; trypsin reaction; integrated system

项目摘要

中文摘要

发展蛋白质多维分离、在线酶解以及质谱鉴定的集成化技术平台对于提高蛋白质组高通量研究的准确度和可信度至关重要。为解决该平台中存在的色谱流动相与蛋白质酶解环境不匹配以及基于在线原位聚合整体材料的酶反应器刚性不足的问题,本项目新型有机纤维素膜接口,能够将1M的盐溶液置换到10 mM以下;制备了无机-有机杂化材料介质的微酶解反应器,能够在30 s和50 s内完成标准蛋白质和复杂蛋白质混合物的酶解;将制备的新型微酶解反应器以及有机膜接口,结合构建的SEC/RPLC蛋白质多维分离系统、多肽反相分离系统以及质谱,构建了集蛋白质分离、在线除盐、在线酶解、多肽分离以及质谱鉴定的一体化蛋白质分离鉴定平台。将其应用于鼠脑提蛋白质的分离鉴定,经3次分析,共鉴定了1476种蛋白质,整个系统峰容量可达5670。发表SCI论文5篇,申请专利3项。

英文摘要

The development of multidimensional separation combined with on-line digestion and MS/MS identification is important for enhancement of the high throughput analysis of proteins. However there are still many problems in the whole platform,such as the mobile phase is unfrindly to the digestion of proteins, and also the monolith of immobilized enzyme reactor(IMER) is not strong enough to perform in the whole analysis.In this project the membrane interface was used to dialyze the salts in samples and using this interface 1M salts could be dialyzed under 10mM.And also The oranic-inorganic hybrid silica monolith was used as the matrix of IMER,as a result the standard protein and the mixture of proteins could be digested within 30s and 50s.Finally an on-line platform involving two dimensional SEC-RPLC separation of proteins,on-line dialysis, on-line digestion and RPLC-MS/MS analysis was established.This platform was used for the mouse brain proteins analysis.As a result 1476 proteins were identified,and the peak capacity was 5670..In this project we published 5 papers embodied by SCI and applied 3 patents.

结题摘要

发展蛋白质多维分离、在线酶解以及质谱鉴定的集成化技术平台对于提高蛋白质组高通量研究的准确度和可信度至关重要。为解决该平台中存在的色谱流动相与蛋白质酶解环境不匹配以及基于在线原位聚合整体材料的酶反应器刚性不足的问题,本项目新型有机纤维素膜接口,能够将1M的盐溶液置换到10 mM以下;制备了无机-有机杂化材料介质的微酶解反应器,能够在30 s和50 s内完成标准蛋白质和复杂蛋白质混合物的酶解;将制备的新型微酶解反应器以及有机膜接口,结合构建的SEC/RPLC蛋白质多维分离系统、多肽反相分离系统以及质谱,构建了集蛋白质分离、在线除盐、在线酶解、多肽分离以及质谱鉴定的一体化蛋白质分离鉴定平台。将其应用于鼠脑提蛋白质的分离鉴定,经3次分析,共鉴定了1476种蛋白质,整个系统峰容量可达5670。发表SCI论文5篇,申请专利3项。

评估说明

    国家自然科学基金项目“蛋白质分离鉴定平台中酶反应器及相关接口的集成化研究”发布于爱科学iikx,并永久归类于相关科学基金导航中,仅供广大科研工作者查询、学习、选题参考。国科金是根据国家发展科学技术的方针、政策和规划,以及科学技术发展方向,面向全国资助基础研究和应用研究,发挥着促进我国基础研究源头创新的作用。国科金的真正价值在于它能否为科学进步和社会发展带来积极的影响。

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