西藏半野生小麦是中国特有的宝贵种质资源，遗传多样性的评价是其保护、开发和利用的基础。本项目是在我们和前人研究工作的基础上，采用新开发出来的EST-SSR和叶绿体SSR标记，对西藏半野生小麦（100多份）的遗传多样性进行大规模评价分析，并与其它类型的小麦作比较，查明其遗传关系，为探讨西藏半野生小麦的起源演化提供分子水平的资料。与此同时，筛选出西藏半野生小麦特有的EST-SSR及与碎穗和包壳基因紧密连锁的分子标记，为标记辅助育种奠定基础.