应用形态学等方法为主，以活体观察、绘图、显微拍照等，研究我国东南沿海海洋鱼类寄生粘孢子虫的形态学,分类学,种类构成,分布,流行情况与水体和寄主的关系及危害性。用PCR、RAPD以及RLFP/PCR等分子标记的方法，同时采用SSUrDNA Sequincing 和EST 等方法，研究分析粘孢子虫的分子标记结果，用于进行粘孢子虫的分子系统学研究。此项研究的意义在于: 1) 将为国内进一步对海洋鱼类寄生粘孢子虫予以系统摸底, 为养殖生产中该类病原的调查与防治研究提供直接的理论指导和参考依据; 2) 利用分子生物学技术来解决传统形态分类学所无法解决的难题，将为打通粘孢子虫分类难的瓶颈开拓一条重要途径; 3) 在理论上将填补我国该大类寄生动物分类区系研究的空白,为我国该类海洋原生动物区系研究、动物地理学研究提供重要的基础资料; 4) 为国际间现今有关该类动物分子系统学研究提供新的基础资料。

应用形态学等方法，较为系统地研究了我国东南沿海约21种海洋鱼类寄生的31种粘孢子虫的形态学（含超微结构）、分类学、寄主及寄生部位、地理分布、感染率与感染强度、对寄主的危害等。所获粘孢子虫涉及粘孢子虫纲的2目、8科、11属。本研究建立了单囊尾虫属(新属) Unicapsulocaudium gen. nov.，描述了22新种，报道了2种国内新记录、7种东海新记录。结果表明，我国的海洋鱼类粘孢子虫的生物多样性很丰富，但是研究还很不充分。研究结果补充和完善了该类寄生虫的基础资料。利用rDNA分子标记的方法，获得了10余种粘孢子虫的18S rDNA部分序列。研究分析了分子标记结果构建的分子系统树。结果显示：海淡水类群分别形成两大支系，厦门弧形虫总是与淡水两极虫支系聚类，而远离海水两极虫支系，故弧形虫系统位置有待进一步研究；巨囊奥巴虫与两极虫-楚克拉虫支系聚类，因此所在科的独立性被质疑；瓶囊碘泡虫被置于鲤科鱼类鳃丝寄生碘泡虫支系，且表现出明显的组织向性。采用rDNA标记，还分析了粘孢子虫的种群遗传变异。运用流式细胞术，探索了该类生物的散射光和自发荧光等物理特性，为该类生物分类提供了新的佐证。