申请人在基因转录的表观遗传调控和mRNA转录后加工的结构机理方面进行了系统深入的研究。主要成果有：1、解析了首个Sir2家族去乙酰化酶的晶体结构，揭示了这一类依赖NAD的去乙酰化酶的催化机制；2、系统性地进行了酵母里转录沉默的结构机理研究；3、解析了典型的两类组蛋白赖氨酸甲基化酶的三维结构；4、揭示了Chromo 和Tudor结构域识别组蛋白赖氨酸甲基化的结构基础；5、解析了数个在mRNA剪接中起重要作用的蛋白质的结构，深化了对于它们在mRNA剪接中的作用的分子机理的理解。拟开展的有关表观遗传调控和mRNA剪接的大复合物研究是高难度的重大科学前沿。申请人多次受邀在国际学术会议上做专题报告，目前是Genes & Development和《中国科学C辑：生命科学》两种科学期刊的编委。

本项目的研究内容是基因表达调控的结构机理研究，主要围绕表观遗传学的结构机理以及mRNA剪接的结构机理两个研究方向，开展重要蛋白质复合物的结构与功能研究。项目实施4年，我们超额完成了计划任务，包括：1）建立并完善了核小体体外重构平台，体外组装了多个蛋白质-核小体复合体，解析了一个核小体与识别蛋白复合体的晶体结构；2）核小体组装方面研究了2种组蛋白伴侣对组蛋白变体的识别和递呈。3）解析了6种新型组蛋白修饰酶、酶复合体及酶结构亚基的晶体结构，较为系统地阐明了这些酶的催化机制、底物特异性以及酶活性调控的结构机理；研究了3种Tudor结构域蛋白特异识别精氨酸和赖氨酸甲基化修饰的结构机理。4）完成了U2snRNP中SF3a亚复合体的结构解析及与RNA的相互作用研究。5）以通讯作者身份发表高水平论文11篇，其中PNAS相当及以上论文8篇，包括NSMB 2篇，Genes & Dev. 3篇，PNAS 2篇，EMBO J. 1篇。