青藓科是侧蒴藓类中最大的科之一，现报道中国有11属80种，分别占世界属的24.4％，种的14.0％。目前对青藓科的分类都建立在配子体和孢子体的形态特征基础上，不同学者对青藓科分类的标准不同，其结果分歧很大。本项目主要运用matK、trnL-F、ITS等分子标记技术，结合形态学特征对我国青藓科现记载的11属80种进行实验研究，探讨属、种间的亲缘和系统演化关系，同时对在分类归并问题上有争议的属：如绿锯

青藓科（Brachytheciaceae）是侧蒴藓类中一个重要的大科，种类较多，种级水平上高度的形态变异和种间性状相互交叉，因此，青藓科的属间、属内种间在分类上一直存在较大分歧。本项目在收集4000份青藓科新鲜标本，借阅118份模式标本的基础上，发现中国新分布种10个，新异名15个，新拟名3个。选取叶绿体DNA trnL-F片段、psbT-H片段、atpB-rbcL片段、matK片段和核糖体ITS序列，运用NJ、MP、 ML 和BI法则分别构建中国青藓科植物系统发育树，并结合形态性状对中国青藓科植物进行全面系统的研究和分析，在此基础上提出中国青藓科新的分类系统，包括14属，与《中国苔藓植物志（第七卷）》记录的11属相比，新增4个属，并提出7个新组合。对分类问题较多的燕尾藓属（Bryhnia），尽可能收集不同地区更多的新鲜标本进行进一步研究，分子研究结果表明Bryhnia是一个多系类群。通过本项研究，培养博士生5名，硕士生2名，发表和将发表论文16篇，参与编写专著3部，提出了中国青藓科植物新的分类系统，为东亚乃至世界青藓科及其相关属的系统研究提供翔实的资料。